RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SHOXO15266 292 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACRP10323 421 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IMPDH2P12268 514 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP4F8P98187 520 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RTP2Q5QGT7 225 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUP43Q8NFH3 380 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NBPF4Q96M43 638 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPON2Q9BUD6 331 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C9IYK1 514 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NFE2L2Q16236 605 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMC6Q7Z403 805 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LDHDQ86WU2 507 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM129CQ86XR2 697 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGDCC3Q8IVU1 814 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 JMJD8Q96S16 334 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TLDC2A0PJX2 215 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLSTN1O94985 981 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAK2Q13177 524 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NFIXQ14938 502 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SASH1O94885 1247 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FGRP09769 529 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPTNQ6XPR3 784 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TM9SF2Q99805 663 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUDT19A8MXV4 375 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NR1I3Q14994 352 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CXorf38Q8TB03 319 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD62A6NC57 917 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GSTM1P09488 218 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYN1P17600 705 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAPKAPK2P49137 400 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CAP1Q01518 475 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MVKQ03426 396 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SP8Q8IXZ3 490 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAT16Q8N8M0 369 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 H0Y8X5 98 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRGAP3O43295 1099 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GP6Q9HCN6 339 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MSL3P1P0C860 447 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF445P59923 1031 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCAF15Q66K64 600 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MKL1Q969V6 931 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQ27 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQ64 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQC6 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQD8 194 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD247P20963 164 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms