RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 ABCB11O95342 1321 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 M0R2N6 131 aa25.38■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 TNFRSF25Q93038 417 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA6Q9UN73 950 aa25.38■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25.38■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.37■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 SLC10A3P09131 477 aa25.36■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.36■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.36■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 MB21D1Q8N884 522 aa25.36■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.34■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 OPLAHO14841 1288 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 UBE2SQ16763 222 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 ATL3Q6DD88 541 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 CFAP45Q9UL16 551 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.34■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
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CTU2-201ENST00000312060 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
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CTU2-201ENST00000312060 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.32■■□□□ 1.64
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CTU2-201ENST00000312060 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.32■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 BTBD7Q9P203 1132 aa25.32■■□□□ 1.64
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CTU2-201ENST00000312060 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 RIPK3Q9Y572 518 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 PIK3CDO00329 1044 aa25.3■■□□□ 1.64
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CTU2-201ENST00000312060 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.3■■□□□ 1.64
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CTU2-201ENST00000312060 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.29■■□□□ 1.64
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CTU2-201ENST00000312060 FIBPO43427 364 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 POLR2MP0CAP2 368 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 ATP2B1P20020 1258 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 TKFCQ3LXA3 575 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 RNF146Q9NTX7 359 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 NFIBO00712 420 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 PEX10O60683 326 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 AP3B2Q13367 1082 aa25.29■■□□□ 1.64
CTU2-201ENST00000312060 NFKBIBQ15653 356 aa25.29■■□□□ 1.64
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