RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Crtc2Q3U182 692 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp953Q3UPV7 304 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gnat3Q3V3I2 354 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GpkowQ56A08 488 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HellsQ60848 821 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam196bQ6GQV1 535 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acap3Q6NXL5 833 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Garem2Q6PAJ3 880 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmcc2Q80W04 706 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dhx38Q80X98 1228 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc7aQ8BGB2 858 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Calhm4Q8CE93 315 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trib2Q8K4K3 343 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ero1aQ8R180 464 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mcoln1Q99J21 580 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttyh1Q9D3A9 450 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdh23Q99PF4 3354 aa6.69□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myh4Q5SX39 1939 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8334F7CD45 553 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nck2O55033 380 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vamp4O70480 141 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adam15O88839 864 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PtpraP18052 829 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NefhP19246 1090 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grm8P47743 908 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Limch1Q3UH68 1057 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ddx4Q61496 702 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stxbp2Q64324 593 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klhl23Q6GQU2 558 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim37Q6PCX9 961 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zkscan8Q8BSL0 588 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TbceQ8CIV8 524 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mov10l1Q99MV5 1187 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcnmb2Q9CZM9 235 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl14Q9D1I6 145 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fmnl1Q9JL26 1094 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Disp2Q8CIP5 1345 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RptorQ8K4Q0 1335 aa6.68□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wfdc16A2A5H4 111 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MyocO70624 490 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnm1P39053 867 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nf2P46662 596 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pnpla5Q32LZ8 432 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc16a10Q3U9N9 512 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Esyt3Q5DTI8 891 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cfap52Q5F201 620 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eif1aQ60872 144 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp90Q61967 636 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nlrp9bQ66X22 1003 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem151bQ68FE7 561 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NexnQ7TPW1 607 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cyp26b1Q811W2 512 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nim1kQ8BHI9 436 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc45a1Q8BIV7 751 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eif1axQ8BMJ3 144 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp38Q8BW70 1042 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Robo4Q8C310 1012 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NsmfQ99NF2 532 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myh15E9Q264 1925 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atf7ipQ7TT18 1306 aa6.67□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm6268A2A3U9 297 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmigd3G3X8R9 209 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3264L7N2C5 238 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Has3O08650 554 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clec11aO88200 328 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nectin2P32507 530 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CtskP55097 329 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col6a1Q04857 1025 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Samd11Q1RNF8 542 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf157Q3TEL6 685 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Skap2Q3UND0 358 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf48Q3US17 591 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klhdc9Q3USL1 350 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Senp6Q6P7W0 1132 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ptk7Q8BKG3 1062 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Shisa4Q8CA71 197 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lmcd1Q8VEE1 365 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lmntd1Q9D4C1 413 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bcl11aQ9QYE3 773 aa6.66□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnah12Q3V0Q1 3086 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rev3lQ61493 3122 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AspmQ8CJ27 3122 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vps13aQ5H8C4 3166 aa6.65□□□□□ -1.34
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mms22lB1AUR6 1238 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.8 ms