Protein–RNA interactions for Protein: O70624

Myoc, Myocilin, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocO70624 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.82■■■■■ 4.77
MyocO70624 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
MyocO70624 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
MyocO70624 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39■■■■□ 3.83
MyocO70624 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
MyocO70624 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
MyocO70624 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
MyocO70624 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
MyocO70624 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MyocO70624 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
MyocO70624 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
MyocO70624 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MyocO70624 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MyocO70624 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
MyocO70624 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MyocO70624 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
MyocO70624 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MyocO70624 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MyocO70624 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MyocO70624 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MyocO70624 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
MyocO70624 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MyocO70624 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MyocO70624 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
MyocO70624 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
MyocO70624 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
MyocO70624 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MyocO70624 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
MyocO70624 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MyocO70624 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MyocO70624 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MyocO70624 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MyocO70624 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
MyocO70624 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MyocO70624 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MyocO70624 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
MyocO70624 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MyocO70624 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MyocO70624 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MyocO70624 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MyocO70624 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MyocO70624 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MyocO70624 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
MyocO70624 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MyocO70624 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MyocO70624 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
MyocO70624 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
MyocO70624 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MyocO70624 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MyocO70624 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MyocO70624 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MyocO70624 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MyocO70624 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
MyocO70624 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
MyocO70624 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MyocO70624 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MyocO70624 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MyocO70624 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MyocO70624 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
MyocO70624 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MyocO70624 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MyocO70624 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MyocO70624 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MyocO70624 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
MyocO70624 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
MyocO70624 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MyocO70624 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MyocO70624 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MyocO70624 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
MyocO70624 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MyocO70624 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MyocO70624 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MyocO70624 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MyocO70624 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MyocO70624 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MyocO70624 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MyocO70624 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MyocO70624 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MyocO70624 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MyocO70624 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MyocO70624 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MyocO70624 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MyocO70624 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MyocO70624 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MyocO70624 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MyocO70624 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MyocO70624 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MyocO70624 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MyocO70624 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MyocO70624 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MyocO70624 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MyocO70624 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MyocO70624 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
MyocO70624 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MyocO70624 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MyocO70624 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MyocO70624 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MyocO70624 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MyocO70624 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MyocO70624 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms