Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
Usp38Q8BW70 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Usp38Q8BW70 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Usp38Q8BW70 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Usp38Q8BW70 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Usp38Q8BW70 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Usp38Q8BW70 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Usp38Q8BW70 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Usp38Q8BW70 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Usp38Q8BW70 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Usp38Q8BW70 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Usp38Q8BW70 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Usp38Q8BW70 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Usp38Q8BW70 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Usp38Q8BW70 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Usp38Q8BW70 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Usp38Q8BW70 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Usp38Q8BW70 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Usp38Q8BW70 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Usp38Q8BW70 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Usp38Q8BW70 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Usp38Q8BW70 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp38Q8BW70 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Usp38Q8BW70 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Usp38Q8BW70 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Usp38Q8BW70 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Usp38Q8BW70 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Usp38Q8BW70 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Usp38Q8BW70 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Usp38Q8BW70 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Usp38Q8BW70 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Usp38Q8BW70 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Usp38Q8BW70 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Usp38Q8BW70 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp38Q8BW70 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Usp38Q8BW70 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp38Q8BW70 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Usp38Q8BW70 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp38Q8BW70 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Usp38Q8BW70 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp38Q8BW70 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp38Q8BW70 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp38Q8BW70 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp38Q8BW70 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp38Q8BW70 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp38Q8BW70 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp38Q8BW70 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Usp38Q8BW70 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Usp38Q8BW70 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp38Q8BW70 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Usp38Q8BW70 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Usp38Q8BW70 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp38Q8BW70 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp38Q8BW70 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp38Q8BW70 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Usp38Q8BW70 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp38Q8BW70 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp38Q8BW70 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp38Q8BW70 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp38Q8BW70 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Usp38Q8BW70 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp38Q8BW70 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp38Q8BW70 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Usp38Q8BW70 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Usp38Q8BW70 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp38Q8BW70 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Usp38Q8BW70 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Usp38Q8BW70 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp38Q8BW70 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp38Q8BW70 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp38Q8BW70 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Usp38Q8BW70 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Usp38Q8BW70 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Usp38Q8BW70 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp38Q8BW70 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Usp38Q8BW70 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Usp38Q8BW70 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Usp38Q8BW70 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp38Q8BW70 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp38Q8BW70 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Usp38Q8BW70 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Usp38Q8BW70 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Usp38Q8BW70 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Usp38Q8BW70 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Usp38Q8BW70 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Usp38Q8BW70 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp38Q8BW70 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Usp38Q8BW70 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Usp38Q8BW70 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Usp38Q8BW70 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Usp38Q8BW70 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Usp38Q8BW70 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Usp38Q8BW70 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Usp38Q8BW70 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Usp38Q8BW70 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Usp38Q8BW70 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp38Q8BW70 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp38Q8BW70 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp38Q8BW70 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp38Q8BW70 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
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