RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	GAL4	P04386	881 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RAM1	P22007	431 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CIN8	P27895	1000 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	FRT2	P39734	528 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YEL057C	P39983	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PIG2	P40187	538 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	TED1	P40533	473 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PEF1	P53238	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RTT109	Q07794	436 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	DDC1	Q08949	612 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CSM4	Q08955	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	LDB19	Q12502	818 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PCT1	P13259	424 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SLY41	P22215	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CMK2	P22517	447 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ATP11	P32453	318 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	HOG1	P32485	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	KAR9	P32526	644 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PET10	P36139	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CDS1	P38221	457 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SSU1	P41930	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	BRO1	P48582	844 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PKP2	P53170	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RAD30	Q04049	632 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
NUP133	YKR082W	DAS2	Q12084	232 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	USO1	P25386	1790 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	GEX2	P36173	615 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	MRPL17	P36528	281 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	TDA3	P38758	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YHR202W	P38887	602 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YIL001W	P40560	513 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YGR042W	P53227	271 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YNL181W	P53878	407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SFG1	Q12507	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	NDI1	P32340	513 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SEC66	P33754	206 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YBR139W	P38109	508 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	MLH1	P38920	769 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	JHD1	P40034	492 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	AAD14	P42884	376 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RSM26	P47141	266 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	DIA3	P52290	468 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YGR117C	P53270	476 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	AQR1	P53943	586 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ROD1	Q02805	837 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	HDA2	Q06629	674 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RCN2	Q12044	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	DCS2	Q12123	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ATP12	P22135	325 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PBN1	P25580	416 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	OAF3	P36023	863 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	AME1	P38313	324 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ASG1	P40467	964 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PRM2	P40534	656 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RTT102	P53330	157 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	BOP3	P53958	396 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	ACS1	Q01574	713 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	YSA1	Q01976	231 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	RSB1	Q08417	382 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PNS1	Q12412	539 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	PSK1	P31374	1356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	VPS63	O13549	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUP133	YKR082W	CBS2	P14905	389 aa		4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.5 ms