RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	PPZ2	P33329	710 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HSL7	P38274	827 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MSR1	P38714	643 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YJL206C	P39529	758 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NUP60	P39705	539 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	KHA1	P40309	873 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NMD5	P46970	1048 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YJR079W	P47126	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	COG6	P53959	839 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SLT2	Q00772	484 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NHX1	Q04121	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	DDC1	Q08949	612 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	GPA2	P10823	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	DMC1	P25453	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YIH1	P25637	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ATG12	P38316	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
CPR4	YCR069W	SCC4	P40090	624 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RCF2	P53721	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SLG1	P54867	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	UGO1	Q03327	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HRD3	Q05787	833 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	VHS3	Q08438	674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NRT1	Q08485	598 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HRT3	Q12347	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ARP7	Q12406	477 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CIT2	P08679	460 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MSH2	P25847	964 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HOG1	P32485	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SGE1	P33335	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YBR225W	P38321	900 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RIM4	P38741	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	FLC2	P39719	783 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YIL166C	P40445	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CDC1	P40986	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YNL320W	P42840	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	TOF2	Q02208	771 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	INP2	Q03824	705 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	PIG1	Q06216	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	TAF3	Q12297	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RAD1	P06777	1100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RAD10	P06838	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HEM15	P16622	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RAD16	P31244	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	THI4	P32318	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	PHO11	P35842	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	BIT2	P38346	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	PHO12	P38693	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SAW1	P39735	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	AVT2	P39981	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	FHN1	P53279	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YNL034W	P53963	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YNL018C	P53976	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	KTR6	P54070	446 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NSE5	Q03718	556 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	TSR4	P25040	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MGT1	P26188	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NDI1	P32340	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SMI1	P32566	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SEC6	P32844	805 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	PEX6	P33760	1030 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	DUG2	P38149	878 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	UBS1	P38290	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SPC97	P38863	823 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	GET2	P40056	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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