RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 YY1AP1Q9H869 796 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBED4O75132 1171 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 E9PMD0 336 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 LIG4P49917 911 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 HINFPQ9BQA5 517 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 SORBS3O60504 671 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 CFBP00751 764 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC39A6Q13433 755 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC9A5Q14940 896 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 PASKQ96RG2 1323 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 ADCY7P51828 1080 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 CABP7Q86V35 215 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.844e-7■■■■□ 20.5
PTPRJ-207ENST00000613246 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF14Q15058 1648 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 USP6NLQ92738 828 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 PHKBQ93100 1093 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM15Q9C019 465 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC1A4P43007 532 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GLG1Q92896 1179 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 HOOK2Q96ED9 719 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 COG4Q9H9E3 785 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PNOCQ13519 176 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF19Q2TAC6 998 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL29Q96CT2 875 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRX1Q86UT6 975 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 GAS7O60861 476 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CPP00450 1065 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINI1Q99574 410 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CHRNA2Q15822 529 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PDXDC1Q6P996 788 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TOM1L1O75674 476 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ATP8B2P98198 1209 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TCP10Q12799 353 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM87BQ96K49 555 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TAF11Q15544 211 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TEX12Q9BXU0 123 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM247A6NEH6 219 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNJ18B7U540 433 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNJ12Q14500 433 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 NAA35Q5VZE5 725 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 CSPG5O95196 566 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KSR2Q6VAB6 950 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF653Q96CK0 615 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 DACH2Q96NX9 599 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 STAMQ92783 540 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 MIS12Q9H081 205 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 KDRP35968 1356 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 RFX6Q8HWS3 928 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.24■□□□□ 0.83
PTPRJ-207ENST00000613246 PANK4Q9NVE7 773 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.5 ms