RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 LIG1P18858 919 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 PRKG1Q13976 671 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 FAM160B2Q86V87 743 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 FEM1BQ9UK73 627 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 USP2O75604 605 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 TTC38Q5R3I4 469 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 AMNQ9BXJ7 453 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQ27 194 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQ64 194 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQD8 194 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 BMP15O95972 392 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 USP14P54578 494 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC183Q5T5S1 534 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 DLK2Q6UY11 383 aa30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 WDR46O15213 610 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 SPP2Q13103 211 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 MTMR2Q13614 643 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO11Q86XK2 927 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF280CQ8ND82 737 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 RIC8AQ9NPQ8 531 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 NF2P35240 595 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 SNAP25P60880 206 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa30.64■■■□□ 2.5
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 FSIP1Q8NA03 581 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 CUL5Q93034 780 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 KIFC2Q96AC6 838 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 GLT8D2Q9H1C3 349 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 POTECB2RU33 542 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 TRAF1Q13077 416 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 PSTPIP2Q9H939 334 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 DACT1Q9NYF0 836 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 BACE1P56817 501 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K9P80192 1104 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.493e-6■■■□□ 18.1
HOXB3-210ENST00000489475 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 WDR90Q96KV7 1748 aa30.62■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 CUTAO60888 179 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF174Q15697 407 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 CDCA5Q96FF9 252 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 NR1I2O75469 434 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 INF2Q27J81 1249 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 CMA1P23946 247 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 IREB2P48200 963 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF445P59923 1031 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 EMILIN3Q9NT22 766 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO28Q9NVF7 368 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 WNT7AO00755 349 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 USH1GQ495M9 461 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 CSADQ9Y600 493 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 VCAM1P19320 739 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 PTPREP23469 700 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 MCM7P33993 719 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 FAM160A1Q05DH4 1040 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 VGLL4Q14135 290 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM260Q9NX78 707 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 SYCE3A1L190 88 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 C19orf81C9J6K1 198 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 TANGO6Q9C0B7 1094 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 NUP62CLQ9H1M0 184 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
HOXB3-210ENST00000489475 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 SLF1Q9BQI6 1058 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 CLEC11AQ9Y240 323 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1B0GVL5 298 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 PTGDRQ13258 359 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 DGKZQ13574 1117 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 CLIC6Q96NY7 704 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 UBE2SQ16763 222 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 CLK2P49760 499 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC174Q6PII3 467 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 NEK8Q86SG6 692 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 ENGASEQ8NFI3 743 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 TBCKQ8TEA7 893 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 FERMT2Q96AC1 680 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXB3-210ENST00000489475 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms