RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439096.2

BBC3-203, Transcript of BCL2 binding component 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BBC3, Length 1,838 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBC3-203ENST00000439096 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.62■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.62■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 USP17L10C9JJH3 530 aa26.61■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 JAG1P78504 1218 aa26.61■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 BCS1LQ9Y276 419 aa26.61■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.61■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 FOXN1O15353 648 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 DHX58Q96C10 678 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 A0A087X0B3 334 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 F5H6K3 240 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 RAD21O60216 631 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 KLRC3Q07444 240 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 SARM1Q6SZW1 724 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 GMCL1Q96IK5 515 aa26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 TBC1D12O60347 775 aa26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 SLFN14P0C7P3 912 aa26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 NEK8Q86SG6 692 aa26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 TRIM5Q9C035 493 aa26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 WNT10BO00744 389 aa26.58■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 PRPHP41219 470 aa26.58■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.58■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.58■■□□□ 1.85
BBC3-203ENST00000439096 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 ZNF75DP51815 510 aa26.58■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 ISM2Q6H9L7 571 aa26.58■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.58■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 SMARCE1Q969G3 411 aa26.58■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.58■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 NDUFB10O96000 172 aa26.57■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 PRR29P0C7W0 189 aa26.57■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TBCKQ8TEA7 893 aa26.57■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.57■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TMEM260Q9NX78 707 aa26.57■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa26.57■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 SMTNL1A8MU46 457 aa26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 PTGER2P43116 358 aa26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 LETM2Q2VYF4 491 aa26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.56■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TXLNAP40222 546 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 IQUBQ8NA54 791 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 CUL5Q93034 780 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 SPATA20Q8TB22 786 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 PAGE5Q96GU1 130 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.55■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 IKBKBO14920 756 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 SMC2O95347 1197 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 BMP3P12645 472 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TNNI2P48788 182 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 E2F4Q16254 413 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.54■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 A0A1W2PRG0 241 aa26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 SHTN1A0MZ66 631 aa26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 NEMFO60524 1076 aa26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 OR52Z1P0C646 297 aa26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 CDC25BP30305 580 aa26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 CLCN1P35523 988 aa26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TPM4P67936 248 aa26.53■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TPM3P06753 285 aa26.52■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 MAP3K10Q02779 954 aa26.52■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 MORC3Q14149 939 aa26.52■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.52■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.52■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 TMX2Q9Y320 296 aa26.52■■□□□ 1.84
BBC3-203ENST00000439096 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
BBC3-203ENST00000439096 AFMP43652 599 aa26.51■■□□□ 1.83
BBC3-203ENST00000439096 RASSF7Q02833 373 aa26.51■■□□□ 1.83
BBC3-203ENST00000439096 NCAPHQ15003 741 aa26.51■■□□□ 1.83
BBC3-203ENST00000439096 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.51■■□□□ 1.83
BBC3-203ENST00000439096 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.833e-11■■■■■ 71.3
BBC3-203ENST00000439096 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.51■■□□□ 1.83
BBC3-203ENST00000439096 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.51■■□□□ 1.83
BBC3-203ENST00000439096 TMEM232C9JQI7 657 aa26.51■■□□□ 1.83
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