RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 GYS2P54840 703 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CYP4F3Q08477 520 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 MAP4K2Q12851 820 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GAB4Q2WGN9 574 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf159Q96HA4 380 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC140Q96MF4 163 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CYP26B1Q9NR63 512 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SEMA3GQ9NS98 782 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PLAAQ9Y263 795 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 WASH4PA8MWX3 477 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 STXBP3O00186 592 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 PLD2O14939 933 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 AURKAO14965 403 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 RFPL3O75679 317 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF205O95201 554 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 CPP00450 1065 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 IGHA1P01876 353 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 IFNGR1P15260 489 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM145Q8NBT3 493 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 COPS5Q92905 334 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 UBE2FQ969M7 185 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TMX1Q9H3N1 280 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TGFB1P01137 390 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 SYPP08247 313 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 FURINP09958 794 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 VAV1P15498 845 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 ECI1P42126 302 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 NOP2P46087 812 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 KCNJ6P48051 423 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 SCRN1Q12765 414 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 NTRK3Q16288 839 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 RTP2Q5QGT7 225 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 NINJ1Q92982 152 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 DUSP13Q9UII6 198 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TCFL5Q9UL49 500 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 C2orf71A6NGG8 1288 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 KCNQ2O43526 872 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC6O75061 913 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 RAPGEF3O95398 923 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 ESR1P03372 595 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 THBDP07204 575 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 GABREP78334 506 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 MSMPQ1L6U9 139 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 TM4SF20Q53R12 229 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-205ENST00000391970 RNF111Q6ZNA4 994 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-205ENST00000391970 NIM1KQ8IY84 436 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 NPLOC4Q8TAT6 608 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-205ENST00000391970 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 SPC25Q9HBM1 224 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 IFT57Q9NWB7 429 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 RNF112Q9ULX5 631 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 BLACEA4D250 179 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-205ENST00000391970 GSTM1P09488 218 aa4.49□□□□□ -1.69
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