RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 WDR24Q96S15 920 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 C19orf44Q9H6X5 657 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 ZSWIM5Q9P217 1185 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 TXNDC16Q9P2K2 825 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF652Q9Y2D9 606 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 GUCY2CP25092 1073 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 CLUL1Q15846 466 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 TNKSO95271 1327 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 OPHN1O60890 802 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 CTDNEP1O95476 244 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 RPL13P26373 211 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 KLHL34Q8N239 644 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 MROH2AA6NES4 1674 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 KRIT1O00522 736 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 PFDN1O60925 122 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 FAM13AO94988 1023 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 BAG2O95816 211 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 GNA11P29992 359 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 MAP7Q14244 749 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC65Q8IXS2 484 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 PLCB1Q9NQ66 1216 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 PRDM4Q9UKN5 801 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF609O15014 1411 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 GNAT2P19087 354 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 PTGDRQ13258 359 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 FAM169AQ9Y6X4 670 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 TXKP42681 527 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 COG7P83436 770 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 NCAPH2Q6IBW4 605 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNS1-201ENST00000306117 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 SFMBT2Q5VUG0 894 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 SPATA1Q5VX52 437 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC197Q8NCU1 140 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 PRR29P0C7W0 189 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 MORC3Q14149 939 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 TMCO4Q5TGY1 634 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 TBC1D10CQ8IV04 446 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 LPIN2Q92539 896 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 FLOT1O75955 427 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CDC27P30260 824 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 NBPF14Q5TI25 921 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 USP37Q86T82 979 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 UBL4BQ8N7F7 174 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 RASGRP4Q8TDF6 673 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 KLHL29Q96CT2 875 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 FERMT1Q9BQL6 677 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CADPS2Q86UW7 1296 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 RAB17Q9H0T7 212 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 TBC1D7Q9P0N9 293 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 TEX33O43247 280 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 GYG1P46976 350 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 POLE2P56282 527 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 KAZALD1Q96I82 304 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 USP17L12C9JPN9 530 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 USP17L21D6R901 530 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 F8W031 263 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CHUKO15111 745 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 VPS41P49754 854 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 NAA35Q5VZE5 725 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 SHC4Q6S5L8 630 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 DENND2AQ9ULE3 1009 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 CXCR5P32302 372 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 PPARAQ07869 468 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 EHHADHQ08426 723 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 PDCLQ13371 301 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 NNTQ13423 1086 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 KRT12Q99456 494 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 PPP6R2O75170 966 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNS1-201ENST00000306117 DNM2P50570 870 aa17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 521.2 ms