RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR096WP47137 282 aa-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RNR4P49723 345 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SOL4P53315 255 aa-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RVB2Q12464 471 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CTF3Q12748 733 aa-0.23□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CAR1P00812 333 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.24□□□□□ -2.45not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRP19P32523 503 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIM23P32897 222 aa-0.24□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNR071CP53757 342 aa-0.24□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TSR1Q07381 788 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KGD1P20967 1014 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CPR4P25334 318 aa-0.25□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS7AP26786 190 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DID4P36108 232 aa-0.25□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DTR1P38125 572 aa-0.25□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR085CP47131 105 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ESF2P53743 316 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PET111P08468 800 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATP12P22135 325 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KTR3P38130 404 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS52P39904 641 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAN6P40459 309 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DJP1P40564 432 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GZF3P42944 551 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POL31P46957 487 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HOL1P53389 586 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL014WQ02606 381 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GTB1Q04924 702 aa-0.26□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DAL2P25335 343 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNC1P31109 117 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EAF5P39995 279 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPO73P40031 143 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAD2P40958 196 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CTK2P46962 323 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DCP2P53550 970 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TOF1P53840 1238 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL193WP53870 558 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIN3Q06449 215 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSK1Q07084 712 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AIM6Q07716 390 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR125WQ12138 136 aa-0.27□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LRE1P25579 583 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LHS1P36016 881 aa-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MIA40P36046 403 aa-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APM3P38153 483 aa-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MNN11P46985 422 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPN14P53196 417 aa-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SDA1P53313 767 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RLI1Q03195 608 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NSE3Q05541 303 aa-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HRT1Q08273 121 aa-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PSK1P31374 1356 aa-0.29□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP2P32499 720 aa-0.29□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRX1P40050 688 aa-0.29□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CSM2P40465 213 aa-0.29□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HEF3P53978 1044 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MCM3P24279 971 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YSP3P25036 478 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RFA2P26754 273 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THI4P32318 326 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSP120P39931 234 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAB1P41733 394 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRI1Q05024 226 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIC1Q06143 298 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG26Q06321 1198 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR195CQ06594 109 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PLB3Q08108 686 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FDH1Q08911 376 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDL009CQ12210 107 aa-0.3□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TPS2P31688 896 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CYS4P32582 507 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SWA2Q06677 668 aa-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SYO1Q07395 620 aa-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NTG2Q08214 380 aa-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CUE5Q08412 411 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAX2Q12465 1220 aa-0.31□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HIP1P06775 603 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AMD1P15274 810 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPS1P32329 569 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPL10P36520 322 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBP12P39538 1254 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATP22P50273 684 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BIO3P50277 480 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ALT2P52892 507 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CRH1P53301 507 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MKC7P53379 596 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKU80Q04437 629 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GLO2Q05584 274 aa-0.32□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 URK1P27515 501 aa-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SOF1P33750 489 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OSH3P38713 996 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HAT2P39984 401 aa-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP82P40368 713 aa-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPN11P43588 306 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.2 ms