RNA–Protein interactions for RNA: YGR030C

POP6, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP6, Length 477 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP6	YGR030C	YML037C	Q03703	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP6	YGR030C	CBP1	P07252	654 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	KAR3	P17119	729 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	TMT1	P32643	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	MIA40	P36046	403 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ELO1	P39540	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	BOP3	P53958	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	MAK10	Q02197	733 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	NGL3	Q03210	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ARP9	Q05123	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ECI1	Q05871	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	UBX3	Q12229	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	RRI2	Q12348	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YIH1	P25637	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	IMP2'	P32351	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	DBP8	P38719	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ANS1	P38832	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	PTR3	P43606	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	IRC8	P47046	822 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	DSD1	P53095	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	EDE1	P34216	1381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	PEP3	P27801	918 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	TSC10	P38342	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	FLC2	P39719	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	HXT9	P40885	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	SGM1	P47166	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	GRC3	Q07845	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	TEN1	Q07921	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	RCN2	Q12044	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	NMD4	Q12129	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	SPE4	Q12455	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ARG81	P05085	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	SGF29	P25554	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	PGS1	P25578	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	GAC1	P28006	793 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	RPN12	P32496	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YIL060W	P40519	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YGR127W	P53275	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	MPS1	P54199	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	COG4	Q06096	861 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	DSE3	Q08729	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	MED1	Q12321	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ICS2	P38284	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	LEU5	P38702	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	FAR3	P46671	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YNL181W	P53878	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	EFM6	P53970	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	SNA4	Q07549	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	CTI6	Q08923	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	IMG1	P25626	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ATO2	P32907	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	UBP11	P36026	717 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	REG2	P38232	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ERP2	P39704	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	PCL6	P40038	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	MRX6	P48564	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	ESBP6	P53918	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	RSM23	Q01163	450 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YEH1	Q07804	573 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	CIR2	Q08822	631 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	RDR1	Q08904	546 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.53	□□□□□ -1.68
POP6	YGR030C	GCN4	P03069	281 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	SNF3	P10870	884 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	MET8	P15807	274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	BOS1	P25385	244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	PDR3	P33200	976 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	YBR144C	P34215	104 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	YPK3	P38070	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	EKI1	Q03764	534 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	MLH2	Q07980	695 aa		4.52	□□□□□ -1.69
POP6	YGR030C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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