RNA–Protein interactions for RNA: YBR229C

ROT2, Transcript of Glucosidase II catalytic subunit, yeast

Gene ROT2, Length 2,865 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROT2	YBR229C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	LOT6	Q07923	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ICL2	Q12031	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	NUS1	Q12063	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	VCX1	Q99385	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TOP3	P13099	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PTM1	P32857	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YBR284W	P38150	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YHL041W	P38730	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YIR007W	P40566	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	IRC5	P43610	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	BNI4	P53858	892 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SED5	Q01590	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	LDB18	Q07887	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GYP1	Q08484	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SUC2	P00724	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GUT2	P32191	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TFB1	P32776	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RIB7	P33312	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SKT5	P34226	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CAF4	P36130	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MSC7	P38694	644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YHR218W	P38899	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	FAD1	P38913	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ESL1	P40456	1118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	IRR1	P40541	1150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MSS2	P40990	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PET130	P47065	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RPA14	P50106	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ORM2	Q06144	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ESC8	Q08119	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SVS1	Q12254	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RAP1	P11938	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CTR86	P25355	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CIN8	P27895	1000 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	STE14	P32584	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	PEP7	P32609	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GIP4	P39732	760 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	STB1	P42845	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ELP2	P42935	788 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TIM13	P53299	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TOF2	Q02208	771 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	NDL1	Q06568	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MCM21	Q06675	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TRE2	Q08693	809 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GPB1	Q08886	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	CIT2	P08679	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	SGF29	P25554	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	FUB1	P25659	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	FUN30	P31380	1131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TVP23	P38962	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	KTR7	P40504	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	OPT1	P40897	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MET13	P53128	600 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RSM24	Q03976	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RAD33	Q04231	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	COS2	P0CX12	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	COS3	P0CX13	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	EMC1	P25574	760 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	TPO5	P36029	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	APE4	P38821	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	VAC8	P39968	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	AVT6	P40074	448 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	COS4	P43542	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	UGO1	Q03327	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	GOT1	Q03554	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RCO1	Q04779	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	RSA1	Q08932	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROT2	YBR229C	HUA2	Q12134	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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