RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 PGK1P00558 417 aa23.78■■□□□ 1.4
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NELFE-212ENST00000492539 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.78■■□□□ 1.4
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NELFE-212ENST00000492539 RIPK3Q9Y572 518 aa23.78■■□□□ 1.4
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NELFE-212ENST00000492539 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
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NELFE-212ENST00000492539 A0A1W2PQY0 241 aa23.76■■□□□ 1.39
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NELFE-212ENST00000492539 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.76■■□□□ 1.39
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NELFE-212ENST00000492539 CDH23Q9H251 3354 aa23.74■■□□□ 1.39
NELFE-212ENST00000492539 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
NELFE-212ENST00000492539 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
NELFE-212ENST00000492539 CEP95Q96GE4 821 aa23.74■■□□□ 1.39
NELFE-212ENST00000492539 FAM161BQ96MY7 647 aa23.74■■□□□ 1.39
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NELFE-212ENST00000492539 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.73■■□□□ 1.39
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NELFE-212ENST00000492539 TOX2Q96NM4 488 aa23.71■■□□□ 1.39
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NELFE-212ENST00000492539 CHST13Q8NET6 341 aa23.7■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 RAG1P15918 1043 aa23.69■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 BMP3P12645 472 aa23.68■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 SLFN13Q68D06 897 aa23.68■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.68■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.68■■□□□ 1.38
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