RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ADALQ6DHV7 355 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF592Q92610 1267 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SPDYE6P0CI01 402 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RASSF7Q02833 373 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 UVSSAQ2YD98 709 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 ODF2Q5BJF6 829 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PROM2Q8N271 834 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 DNM3Q9UQ16 869 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 LAD1O00515 517 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB5O15062 677 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 BICDL2A1A5D9 508 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CABP7Q86V35 215 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 COA7Q96BR5 231 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 NYAP2Q9P242 653 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 GINM1Q9NU53 330 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PDE4DQ08499 809 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 DACT2Q5SW24 774 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TYRO3Q06418 890 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF202O95125 648 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RASA1P20936 1047 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 DPP9Q86TI2 863 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 LPAR1Q92633 364 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO40Q9UH90 709 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CACNA1FO60840 1977 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 DPF2Q92785 391 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 OTUD5Q96G74 571 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TCHPQ9BT92 498 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SPC25Q9HBM1 224 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 POTEB2H3BUK9 544 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SMTNP53814 917 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PTGDRQ13258 359 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 GPC2Q8N158 579 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CDHR1Q96JP9 859 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 RGPD5Q99666 1765 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 KRT13P13646 458 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 MAP3K9P80192 1104 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SPECC1Q5M775 1068 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 C19orf81C9J6K1 198 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 POTEJP0CG39 1038 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 PKP1Q13835 747 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 SLC39A14Q15043 492 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 TBCKQ8TEA7 893 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 MRIQ9BWK5 157 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 N4BP3O15049 544 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRD-211ENST00000486161 AP3B2Q13367 1082 aa9.29□□□□□ -0.92
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