RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000085989.6

Cldn9-201, Transcript of Claudin-9, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Cldn9, Length 1,435 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ddit3P35639 168 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Onecut3Q8K557 490 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Zmym2Q9CU65 1376 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 PfasQ5SUR0 1337 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Trim12cD3Z3L3 497 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Rbp3P49194 1234 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Gnat2P50149 354 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Eepd1Q3TGW2 569 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Limch1Q3UH68 1057 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ssh1Q76I79 1042 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ms4a5Q810P8 197 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Cnksr3Q8BMA3 555 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 GldcQ91W43 1025 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Clstn1Q9EPL2 979 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Galk1Q9R0N0 392 aa16.11■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 NapbP28663 298 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ccdc174Q3U155 467 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Tshz1Q5DTH5 1084 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Kctd1Q5M956 257 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Gas6Q61592 674 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Usp6nlQ80XC3 819 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 BC048507Q80ZS7 89 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Tdp1Q8BJ37 609 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Smad3Q8BUN5 425 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Brf1Q8CFK2 676 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 DaglbQ91WC9 669 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Eaf2Q91ZD6 262 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Armcx1Q9CX83 456 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 PdhbQ9D051 359 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Lonrf3Q9D4H7 753 aa16.1■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Jbts17Q8CE72 3214 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 SpibO35906 267 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Pde11aP0C1Q2 933 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Alppl2P24823 529 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ftl1P29391 183 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Defb25Q30KN8 71 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Susd3Q9D176 269 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Trmt112Q9DCG9 125 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Clip2Q9Z0H8 1047 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Lamb1P02469 1786 aa16.09■□□□□ 0.17
Cldn9-201ENSMUST00000085989 TroapB7ZNG4 668 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Slc1a4O35874 532 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Srebf2Q3U1N2 1130 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Myo19Q5SV80 963 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Zfp943Q6NZP4 507 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Usp50Q6P8X6 390 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Tbx20Q9ES03 445 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Msgn1Q9JK54 188 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa16.08■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Dock2Q8C3J5 1828 aa16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ankrd35E9Q9D8 996 aa16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Pbx2O35984 430 aa16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 LdhbP16125 334 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Phka1P18826 1241 aa16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ccl5P30882 91 aa16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Cypt4Q6P925 153 aa16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Plxnb3Q9QY40 1902 aa16.07■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Dnajc25A2ALW5 357 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Pate3B3GLJ3 98 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Zscan18E9PUD6 809 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Gm20503G3UZK1 150 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Il13ra2O88786 383 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Inpp5jP59644 1003 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Fbxo10Q7TQF2 950 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Ccdc178Q8CDV0 866 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Etv3Q8R4Z4 513 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Znf287Q9EQB9 759 aa16.06■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Fyb2A2A995 729 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Cst8P32766 142 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Tp53i13Q5F267 385 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Phlda1Q62392 405 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 MyripQ8K3I4 856 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Gmcl1Q920G9 524 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Cep72Q9D3R3 646 aa16.05■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Tmem240B2RWJ3 173 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Rnf19aP50636 840 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Carmil2Q3V3V9 1296 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Znf280dQ68FE8 974 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Tekt3Q6X6Z7 490 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Vps53Q8CCB4 832 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Mia3Q8BI84 1930 aa16.04■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Hmox1P14901 289 aa16.03■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Defa-rs2P17534 91 aa16.03■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Traf1P39428 409 aa16.03■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Psmc6P62334 389 aa16.03■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Pla2g6P97819 807 aa16.03■□□□□ 0.16
Cldn9-201ENSMUST00000085989 Stxbp3Q60770 592 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms