Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
Plxnb3Q9QY40 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
Plxnb3Q9QY40 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Plxnb3Q9QY40 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Plxnb3Q9QY40 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Plxnb3Q9QY40 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Plxnb3Q9QY40 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Plxnb3Q9QY40 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Plxnb3Q9QY40 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Plxnb3Q9QY40 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Plxnb3Q9QY40 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Plxnb3Q9QY40 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Plxnb3Q9QY40 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Plxnb3Q9QY40 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Plxnb3Q9QY40 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Plxnb3Q9QY40 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Plxnb3Q9QY40 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Plxnb3Q9QY40 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Plxnb3Q9QY40 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Plxnb3Q9QY40 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Plxnb3Q9QY40 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Plxnb3Q9QY40 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Plxnb3Q9QY40 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Plxnb3Q9QY40 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Plxnb3Q9QY40 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Plxnb3Q9QY40 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Plxnb3Q9QY40 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Plxnb3Q9QY40 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Plxnb3Q9QY40 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Plxnb3Q9QY40 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Plxnb3Q9QY40 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Plxnb3Q9QY40 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Plxnb3Q9QY40 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Plxnb3Q9QY40 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Plxnb3Q9QY40 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Plxnb3Q9QY40 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Plxnb3Q9QY40 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Plxnb3Q9QY40 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Plxnb3Q9QY40 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Plxnb3Q9QY40 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Plxnb3Q9QY40 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Plxnb3Q9QY40 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Plxnb3Q9QY40 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Plxnb3Q9QY40 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Plxnb3Q9QY40 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Plxnb3Q9QY40 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Plxnb3Q9QY40 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Plxnb3Q9QY40 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Plxnb3Q9QY40 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Plxnb3Q9QY40 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Plxnb3Q9QY40 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Plxnb3Q9QY40 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Plxnb3Q9QY40 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Plxnb3Q9QY40 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Plxnb3Q9QY40 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Plxnb3Q9QY40 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Plxnb3Q9QY40 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Plxnb3Q9QY40 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Plxnb3Q9QY40 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Plxnb3Q9QY40 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Plxnb3Q9QY40 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Plxnb3Q9QY40 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Plxnb3Q9QY40 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Plxnb3Q9QY40 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Plxnb3Q9QY40 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Plxnb3Q9QY40 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Plxnb3Q9QY40 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Plxnb3Q9QY40 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Plxnb3Q9QY40 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Plxnb3Q9QY40 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Plxnb3Q9QY40 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Plxnb3Q9QY40 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Plxnb3Q9QY40 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Plxnb3Q9QY40 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Plxnb3Q9QY40 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Plxnb3Q9QY40 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Plxnb3Q9QY40 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Plxnb3Q9QY40 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Plxnb3Q9QY40 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Plxnb3Q9QY40 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Plxnb3Q9QY40 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Plxnb3Q9QY40 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Plxnb3Q9QY40 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Plxnb3Q9QY40 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Plxnb3Q9QY40 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Plxnb3Q9QY40 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Plxnb3Q9QY40 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Plxnb3Q9QY40 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Plxnb3Q9QY40 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Plxnb3Q9QY40 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Plxnb3Q9QY40 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Plxnb3Q9QY40 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Plxnb3Q9QY40 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Plxnb3Q9QY40 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Plxnb3Q9QY40 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Plxnb3Q9QY40 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Plxnb3Q9QY40 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Plxnb3Q9QY40 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms