Protein–RNA interactions for Protein: Q62392

Phlda1, Pleckstrin homology-like domain family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phlda1Q62392 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
Phlda1Q62392 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Phlda1Q62392 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Phlda1Q62392 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Phlda1Q62392 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Phlda1Q62392 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Phlda1Q62392 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Phlda1Q62392 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Phlda1Q62392 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Phlda1Q62392 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Phlda1Q62392 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Phlda1Q62392 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Phlda1Q62392 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Phlda1Q62392 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Phlda1Q62392 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Phlda1Q62392 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Phlda1Q62392 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Phlda1Q62392 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Phlda1Q62392 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Phlda1Q62392 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Phlda1Q62392 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Phlda1Q62392 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Phlda1Q62392 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Phlda1Q62392 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Phlda1Q62392 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Phlda1Q62392 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Phlda1Q62392 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Phlda1Q62392 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Phlda1Q62392 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Phlda1Q62392 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Phlda1Q62392 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Phlda1Q62392 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Phlda1Q62392 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Phlda1Q62392 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Phlda1Q62392 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Phlda1Q62392 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Phlda1Q62392 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Phlda1Q62392 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Phlda1Q62392 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Phlda1Q62392 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Phlda1Q62392 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Phlda1Q62392 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Phlda1Q62392 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Phlda1Q62392 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Phlda1Q62392 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Phlda1Q62392 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Phlda1Q62392 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Phlda1Q62392 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Phlda1Q62392 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Phlda1Q62392 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Phlda1Q62392 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Phlda1Q62392 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Phlda1Q62392 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Phlda1Q62392 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Phlda1Q62392 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Phlda1Q62392 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Phlda1Q62392 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Phlda1Q62392 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Phlda1Q62392 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Phlda1Q62392 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Phlda1Q62392 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Phlda1Q62392 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Phlda1Q62392 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Phlda1Q62392 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Phlda1Q62392 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Phlda1Q62392 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Phlda1Q62392 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Phlda1Q62392 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Phlda1Q62392 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Phlda1Q62392 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Phlda1Q62392 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Phlda1Q62392 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Phlda1Q62392 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Phlda1Q62392 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Phlda1Q62392 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Phlda1Q62392 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Phlda1Q62392 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Phlda1Q62392 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Phlda1Q62392 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Phlda1Q62392 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Phlda1Q62392 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Phlda1Q62392 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Phlda1Q62392 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Phlda1Q62392 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Phlda1Q62392 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Phlda1Q62392 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Phlda1Q62392 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Phlda1Q62392 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Phlda1Q62392 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Phlda1Q62392 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Phlda1Q62392 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Phlda1Q62392 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Phlda1Q62392 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Phlda1Q62392 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Phlda1Q62392 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Phlda1Q62392 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Phlda1Q62392 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Phlda1Q62392 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Phlda1Q62392 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Phlda1Q62392 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms