RNA–Protein interactions for RNA: YHR077C

NMD2, Transcript of Protein involved in the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway, yeast

Gene NMD2, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD2	YHR077C	JLP1	Q12358	412 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ICT1	Q12385	394 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	RAP1	P11938	827 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ABF1	P14164	731 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	MRPS28	P21771	286 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YCR099C	P25657	155 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	TFA2	P36145	328 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	MRP21	P38175	177 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	BZZ1	P38822	633 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	GIP4	P39732	760 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	VHR1	P40522	640 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	PRM2	P40534	656 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	MRK1	P50873	501 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SLM2	P53955	656 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SPO20	Q04359	397 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	RCO1	Q04779	684 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	GGA1	Q06336	557 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ESC8	Q08119	714 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	NDD1	Q08887	554 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	NUS1	Q12063	375 aa		3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	STE6	P12866	1290 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	CLB4	P24871	460 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SLM4	P38247	162 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	IST2	P38250	946 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YBR285W	P38354	144 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	HAT2	P39984	401 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	CNN1	P43618	361 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	TEL2	P53038	688 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	VPS62	P53285	467 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SDH1	Q00711	640 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SPR6	Q01684	191 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	HFD1	Q04458	532 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	DYN3	Q04949	312 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	IRC10	Q08118	586 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YSP3	P25036	478 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ASK1	P35734	292 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.99	□□□□□ -1.93	not detected
NMD2	YHR077C	SNL1	P40548	159 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	FMP32	P43557	207 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ATH1	P48016	1211 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	NAS6	P50086	228 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	MET13	P53128	600 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	COQ6	P53318	479 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	CDC14	Q00684	551 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	GCN5	Q03330	439 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SMP3	Q04174	516 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	RIF2	Q06208	395 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YPQ1	Q12010	308 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SEC15	P22224	910 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	PGS1	P25578	521 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SOL2	P37262	315 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YBL029W	P38201	376 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ERV46	P39727	415 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	AGP3	P43548	558 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YKU80	Q04437	629 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YDR124W	Q04608	324 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ATG26	Q06321	1198 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	NDJ1	Q12366	352 aa		2.99	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	MRPL8	P22353	238 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	VPS34	P22543	875 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	EMC1	P25574	760 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	ZIP1	P31111	875 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	FUN30	P31380	1131 aa		2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
NMD2	YHR077C	SAF1	P38352	637 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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