RNA–Protein interactions for RNA: YHL038C

CBP2, Required for splicing of the group I intron bI5 of the COB pre-mRNA, yeast

Gene CBP2, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP2	YHL038C	CKA1	P15790	372 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	MAL33	P38157	468 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	NPR2	P39923	615 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	JHD1	P40034	492 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	NPA3	P47122	385 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YML119W	Q03208	357 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	TAF11	Q04226	346 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YDL242W	Q07746	117 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	LTE1	P07866	1435 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CAT8	P39113	1433 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CDC43	P18898	376 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	OCA4	P25366	362 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	PXA2	P34230	853 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	PIM1	P36775	1133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YPT10	P38146	199 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	REG2	P38232	338 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	AFG3	P39925	761 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	MRX6	P48564	524 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	VPS75	P53853	264 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	MUK1	Q02866	612 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	UBX2	Q04228	584 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CRN1	Q06440	651 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	ARR1	Q06596	294 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	BAG7	Q12128	409 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	NMD4	Q12129	218 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	MET17	P06106	444 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	KIN3	P22209	435 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	AMD2	P22580	549 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	POL4	P25615	582 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	LAC1	P28496	418 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	GDA1	P32621	518 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YME2	P32843	850 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	BLI1	P35727	113 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	AGP2	P38090	596 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	INN1	P53901	409 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YPL071C	Q02864	156 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	NGL3	Q03210	505 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	WAR1	Q03631	944 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	SWA2	Q06677	668 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	RAD50	P12753	1312 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	RKR1	Q04781	1562 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CBS1	P14066	229 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	DAL5	P15365	543 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	DMC1	P25453	334 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	HES1	P35843	434 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	ERC1	P38767	581 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	SPO22	P40511	975 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	GLO1	P50107	326 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YNL092W	P53934	400 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YAT1	P80235	687 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	SPO19	Q03029	223 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.16	□□□□□ -1.9	not detected
CBP2	YHL038C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	ATG2	P53855	1592 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	PSK1	P31374	1356 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	AUS1	Q08409	1394 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	DNF2	Q12675	1612 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	TPK2	P06245	380 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YKL050C	P35736	922 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	GEX2	P36173	615 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	STB4	P50104	949 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	CPR8	P53728	308 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YML037C	Q03703	340 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	PLM2	Q04383	521 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	YPL191C	Q08930	360 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	LCB4	Q12246	624 aa		3.16	□□□□□ -1.9
CBP2	YHL038C	RPO31	P04051	1460 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	STE12	P13574	688 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	VMA16	P23968	213 aa		3.15	□□□□□ -1.91
CBP2	YHL038C	BRF1	P29056	596 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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