RNA–Protein interactions for RNA: YGR165W

MRPS35, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS35, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS35	YGR165W	UBP13	P38187	747 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	CIR1	P42940	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YPR003C	P53394	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	MUB1	Q03162	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	HUA2	Q12134	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPS35	YGR165W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	PRE8	P23639	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	FLO10	P36170	1169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ESL1	P40456	1118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	AAD10	P47182	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	TIM10	P87108	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	NGL3	Q03210	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ARO10	Q06408	635 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	BI2	P03873	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	CDC15	P27636	974 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	MAL33	P38157	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	RTS1	P38903	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ERV46	P39727	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	DSD1	P53095	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	LCL3	P53153	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	GSY2	P27472	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YBL029W	P38201	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	RSM28	Q03430	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SDH5	Q08230	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	CIR2	Q08822	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SGF29	P25554	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	POL4	P25615	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	PEX2	P32800	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	HOT13	P36078	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	FTH1	P38310	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YAP3	P38749	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ASG1	P40467	964 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	THI3	Q07471	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	TCO89	Q08921	799 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	RTP1	Q12751	981 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	PET111	P08468	800 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	KAR3	P17119	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	MAK32	P23060	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	LHS1	P36016	881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YBR225W	P38321	900 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	BUR6	P40096	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	CIN1	P40987	1014 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	MFB1	Q04922	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ARP9	Q05123	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	OSW1	Q08692	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ERG11	P10614	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	ECM10	P39987	644 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	MRX1	P40050	688 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YFR020W	P43600	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	BSP1	Q06604	576 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS35	YGR165W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS35	YGR165W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS35	YGR165W	MRP7	P12687	371 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS35	YGR165W	PEP3	P27801	918 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS35	YGR165W	JNM1	P36224	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS35	YGR165W	MNN2	P38069	597 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS35	YGR165W	NPR2	P39923	615 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS35	YGR165W	PHM8	P40025	321 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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