RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C CSM3Q04659 317 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MLH2Q07980 695 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C AIM41Q12032 185 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TIP41Q12199 356 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ERP3Q12403 225 aa2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PNO1Q99216 274 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TUF1P02992 437 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SES1P07284 462 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C FRS2P15625 503 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ALG1P16661 449 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TKL1P23254 680 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MSP1P28737 362 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MCM4P30665 933 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C UBP11P36026 717 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C REG2P38232 338 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C EXO84P38261 753 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C FAA2P39518 744 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CIR1P42940 261 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YGR153WP48238 217 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RTC4P53850 401 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CNM67P53865 581 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C EAF7P53911 425 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ECM9Q02202 377 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ARP6Q12509 438 aa2.44□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MYO1P08964 1928 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HMG2P12684 1045 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MCM3P24279 971 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C BMH1P29311 267 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TFC4P33339 1025 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RMA1P36001 430 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C OAF3P36023 863 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C DBP7P36120 742 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C FTH1P38310 465 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PSF2P40359 213 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C GPD2P41911 440 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YHM2Q04013 314 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YMR321CQ04898 105 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YLR281CQ05863 155 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MMR1Q06324 491 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YLH47Q06493 454 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CRD1Q07560 283 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PSR2Q07949 397 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ICL2Q12031 575 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SMC6Q12749 1114 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C DDP1Q99321 188 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C FOB1O13329 566 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YPK1P12688 680 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CLN3P13365 580 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C POX1P13711 748 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CKA2P19454 339 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ROX1P25042 368 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CDC15P27636 974 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RPN12P32496 274 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PAH1P32567 862 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YKT6P36015 200 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C DID4P36108 232 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TVP38P36164 337 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SCO2P38072 301 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C IMD2P38697 523 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C NPR3P38742 1146 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C HMF1P40037 129 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RSM25P40496 264 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C FIS1P40515 155 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CIN1P40987 1014 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ZAP1P47043 880 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YPT11P48559 417 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C IMD3P50095 523 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CBK1P53894 756 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PGA2P53903 129 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C SNU56Q03782 492 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PHM6Q05637 104 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C CRT10Q08226 957 aa2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C GAL4P04386 881 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C RPL22AP05749 121 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C GPA1P08539 472 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YFL068WP0CX99 160 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YLL066W-AP0CY00 160 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C YLL067W-AP0CY01 160 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PCK1P10963 549 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C MAS2P11914 482 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C TCP1P12612 559 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C VPS33P20795 691 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C LSB5P25369 354 aa2.41□□□□□ -2.02
GCN4YEL009C PPZ1P26570 692 aa2.41□□□□□ -2.02
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