RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 RS1O15537 224 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CTIFO43310 598 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 SASH3O75995 380 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 MOCS3O95396 460 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 IGHDP01880 384 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 DNAH10OSP0CZ25 163 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 GYS1P13807 737 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 EDN3P14138 238 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 INSRRP14616 1297 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CBLP22681 906 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 TNFRSF8P28908 595 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 ZNF76P36508 570 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 PMELP40967 661 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 METAP1P53582 386 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 PROX2Q3B8N5 592 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 PRR16Q569H4 304 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 NOMO2Q5JPE7 1267 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 C20orf194Q5TEA3 1177 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 PPP4R3AQ6IN85 833 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 SCUBE1Q8IWY4 988 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 GLIS3Q8NEA6 775 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 UHRF2Q96PU4 802 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CFHR5Q9BXR6 569 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 KRT84Q9NSB2 600 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 STAG3Q9UJ98 1225 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 KCNH4Q9UQ05 1017 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CACNA1SQ13698 1873 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 PCDH15Q96QU1 1955 aa-1.38□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 ADGRL1O94910 1474 aa-1.38□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CLEC18AA5D8T8 446 aa-1.39□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 FCHO1O14526 889 aa-1.39□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 GABBR2O75899 941 aa-1.39□□□□□ -2.63
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SNORD54-201ENST00000459159 LTBRP36941 435 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CD96P40200 585 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 MASP1P48740 699 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 EPHB1P54762 984 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP-1.39□□□□□ -2.631e-323■■■■■ 136.5
SNORD54-201ENST00000459159 SP6Q3SY56 376 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZR54 194 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 USP48Q86UV5 1035 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 RNF152Q8N8N0 203 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 C15orf53Q8NAA6 179 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CLEC18CQ8NCF0 446 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 KREMEN2Q8NCW0 462 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 VOPP1Q96AW1 172 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 C17orf77Q96MU5 243 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 IMUPQ9GZP8 106 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 NBPF3Q9H094 633 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CREBZFQ9NS37 354 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 NDFIP2Q9NV92 336 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 HSPBP1Q9NZL4 362 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 SEMA5BQ9P283 1151 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CELA1Q9UNI1 258 aa-1.39□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF804BA4D1E1 1349 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf142B7Z368 130 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 ABLIM1O14639 778 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 PPFIA3O75145 1194 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 CFBP00751 764 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 GP1BBP13224 206 aa-1.4□□□□□ -2.63
SNORD54-201ENST00000459159 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
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