RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM199Q8N511 208 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 MROH8Q9H579 483 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.2■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 AKR1A1P14550 325 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 CDK7P50613 346 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 MYH8P13535 1937 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.19■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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SPCS1-201ENST00000233025 COG2Q14746 738 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 IL23AQ9NPF7 189 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 COG5Q9UP83 839 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM22K7EJ46 135 aa20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ANP32CO43423 234 aa20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TFCP2Q12800 502 aa20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 MB21D1Q8N884 522 aa20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 TINF2Q9BSI4 451 aa20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.17■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.16■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 GUCY1A2P33402 732 aa20.16■□□□□ 0.82
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SPCS1-201ENST00000233025 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.16■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 ELP1O95163 1332 aa20.16■□□□□ 0.82
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SPCS1-201ENST00000233025 PRR33A8MZF0 331 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPCS1-201ENST00000233025 MYOGP15173 224 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPCS1-201ENST00000233025 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPCS1-201ENST00000233025 EHD4Q9H223 541 aa20.15■□□□□ 0.82
SPCS1-201ENST00000233025 CD320Q9NPF0 282 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPCS1-201ENST00000233025 PLS1Q14651 629 aa20.14■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.14■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.14■□□□□ 0.81
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SPCS1-201ENST00000233025 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.14■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.14■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 FGBP02675 491 aa20.13■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 PGK2P07205 417 aa20.13■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.13■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.13■□□□□ 0.81
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SPCS1-201ENST00000233025 RFXAPO00287 272 aa20.12■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SHMT1P34896 483 aa20.12■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.12■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 ATG4CQ96DT6 458 aa20.12■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP54Q96N23 3096 aa20.12■□□□□ 0.81
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SPCS1-201ENST00000233025 CD4P01730 458 aa20.11■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.11■□□□□ 0.81
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SPCS1-201ENST00000233025 MMP19Q99542 508 aa20.11■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 CABP5Q9NP86 173 aa20.11■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.11■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SEPT2Q15019 361 aa20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 GORABQ5T7V8 394 aa20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 HLA-CQ95604 372 aa20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 TRIOO75962 3097 aa20.1■□□□□ 0.81
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRSQ13332 1948 aa20.1■□□□□ 0.81
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