RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	LHS1	P36016	881 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YBR284W	P38150	797 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	APM3	P38153	483 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YMR262W	P38430	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YHR054C	P38780	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	VMA22	P38784	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DUN1	P39009	513 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SAW1	P39735	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PSF2	P40359	213 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CAB2	P40506	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DSN1	P40568	576 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	BNA2	P47125	453 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YGR117C	P53270	476 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	DIP5	P53388	608 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SAM50	P53969	484 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RSN1	Q03516	953 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TPP1	Q03796	238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HLR1	Q04429	423 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CRF1	Q04930	467 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	VPS38	Q05919	439 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	VPS74	Q06385	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NUR1	Q12066	484 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MED4	Q12343	284 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MTF2	P10849	440 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RAP1	P11938	827 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HOP1	P20050	605 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	UTR1	P21373	530 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GID7	P25569	745 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	GEX1	P25596	615 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PEP3	P27801	918 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	STE13	P33894	931 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NNK1	P36003	928 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SDS22	P36047	338 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HEL1	P36113	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	REV7	P38927	245 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SUR2	P38992	349 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	LRO1	P40345	661 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RSM25	P40496	264 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YFL052W	P43551	465 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RNT1	Q02555	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	CSI1	Q04368	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SNO4	Q04902	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MMR1	Q06324	491 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ARO10	Q06408	635 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	HSP32	Q08992	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SOD2	P00447	233 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MET3	P08536	511 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SAM35	P14693	329 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CLB3	P24870	427 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MEI4	P29467	408 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CPR5	P35176	225 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CHK1	P38147	527 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	NEM1	P38757	446 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TDA3	P38758	523 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SCC4	P40090	624 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	APS3	P47064	194 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	URB2	P47108	1174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MON1	P53129	644 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BSC5	P53755	489 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VPS75	P53853	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ARP4	P80428	489 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ECM9	Q02202	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MSC3	Q05812	728 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	FMP45	Q07651	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PUS9	Q12069	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms