RNA–Protein interactions for RNA: YDR107C

TMN2, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeast

Gene TMN2, Length 2,019 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMN2	YDR107C	UFD4	P33202	1483 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	MLP2	P40457	1679 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TMN2	YDR107C	COQ2	P32378	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YJL206C	P39529	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MEF2	P39677	819 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
TMN2	YDR107C	USA1	Q03714	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MCA1	Q08601	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	LAS17	Q12446	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SKS1	Q12505	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TMN2	YDR107C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MPS3	P47069	682 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YGR066C	P53242	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	FHN1	P53279	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	GTB1	Q04924	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TRM732	Q03496	1420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PRP28	P23394	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YBR053C	P38235	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PLB1	P39105	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PIG2	P40187	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MAF1	P41910	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MMR1	Q06324	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CYC7	P00045	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	STF1	P01098	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YSP3	P25036	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SNT1	P25357	1226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TAT1	P38085	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	NAS2	P40555	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CTK2	P46962	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SEC5	P89102	971 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	INA17	Q02888	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
TMN2	YDR107C	FRE5	Q08908	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ATG29	Q12092	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	AFI1	Q99222	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CPR2	P23285	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	HEL1	P36113	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MNN2	P38069	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SDH8	P38345	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YGR079W	P53249	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	VPS38	Q05919	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	GAL80	P04387	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CDC20	P26309	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SYN8	P31377	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PMT1	P33775	817 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	KAE1	P36132	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	UIP5	P36137	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SIF2	P38262	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	FTH1	P38310	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YIR042C	P40586	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SWP82	P43554	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CUL3	P53202	744 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TOF1	P53840	1238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YNL058C	P53947	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	ATG23	Q06671	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	FET5	P43561	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	MUP1	P50276	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SPC98	P53540	846 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	SOV1	Q04748	898 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	RXT3	Q07458	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TMN2	YDR107C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.3 ms