RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W PIB2P53191 635 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PBP1P53297 722 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W COS6P53344 381 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W ARP4P80428 489 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SPR28Q04921 423 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W NKP2Q06162 153 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PUS9Q12069 462 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SNF2P22082 1703 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SST2P11972 698 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W HAP4P14064 554 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CDC23P16522 626 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W COX11P19516 300 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RPD3P32561 433 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RAD24P32641 659 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SEC61P32915 480 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CLG1P35190 452 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data5.17□□□□□ -1.58not detected
CYK3YDL117W SSH1P38353 490 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W ICE2P40499 491 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W IMA5P40884 581 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YFR018CP43599 363 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W LOH1P47055 219 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YJR056CP47115 236 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YGR237CP50089 785 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W DBP6P53734 629 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W NGL3Q03210 505 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W MRL1Q06815 381 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PEX15Q08215 383 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SAM3Q08986 587 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YDR056CQ12025 205 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YOR019WQ99248 730 aa5.17□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GAL3P13045 520 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GSY1P23337 708 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GRX1P25373 110 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GSH1P32477 678 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PET127P32606 800 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RMA1P36001 430 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W FTH1P38310 465 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SUR2P38992 349 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SSP120P39931 234 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W ALG8P40351 577 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W VMA13P41807 478 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PSP1P50896 841 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RMR1P53060 241 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W BRE5P53741 515 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W BOP3P53958 396 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W DAK1P54838 584 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YDR249CQ03787 373 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W NUT2Q06213 157 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GPN3Q06543 272 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YPR084WQ06821 456 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SSP2Q08646 371 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RAX1Q08760 435 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W DIN7Q12086 430 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RUP1Q12242 671 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PNS1Q12412 539 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CAR2P07991 424 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YAK1P14680 807 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W IDI1P15496 288 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W PHO13P19881 312 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SCO2P38072 301 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CSM2P40465 213 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W ASE1P50275 885 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W COG1P53079 417 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W VPS75P53853 264 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YNL034WP53963 612 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YNL018CP53976 612 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W MUK1Q02866 612 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YDR476CQ03362 224 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YMD8Q03697 442 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GTB1Q04924 702 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W TOS4Q06266 489 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GSH2Q08220 491 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YPL216WQ08964 1102 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W GIS3Q12418 502 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W RMP1Q12530 201 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W APM4Q99186 491 aa5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CCP1P00431 361 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CDC8P00572 216 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W URA3P03962 267 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W ARG80P07249 177 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W CNB1P25296 175 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W SEC65P29478 273 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W MCM10P32354 571 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YUH1P35127 236 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W AST1P35183 429 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W TAF14P35189 244 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W STB6P36085 766 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YBR062CP38239 180 aa5.15□□□□□ -1.58
CYK3YDL117W YER010CP40011 234 aa5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.5 ms