RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W YKL077WP36081 392 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MRPL36P36531 177 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YHL041WP38730 149 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SPL2P38839 148 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W AIM46P38885 310 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SPO73P40031 143 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SMC3P47037 1230 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W COG6P53959 839 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YML131WQ03102 365 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W MED1Q12321 566 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W GCR1P07261 785 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W NPR1P22211 790 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W STE5P32917 917 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W QNS1P38795 714 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W HIS6P40545 261 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W SAP4P53036 818 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W PEX25Q02969 394 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W FDC1Q03034 503 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W REX3Q12090 404 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2.97□□□□□ -1.93
SIN3YOL004W INO1P11986 533 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YME2P32843 850 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CAB3P36076 571 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HXT10P43581 546 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RET2P43621 546 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MET12P46151 657 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TOM22P49334 152 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MLC1P53141 149 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TOS4Q06266 489 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SKG3Q06315 1026 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TUF1P02992 437 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W MPH2P0CD99 609 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HCS1P34243 683 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YKL069WP36088 180 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RPC37P36121 282 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RFC1P38630 861 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PRM9P39551 298 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PPT1P53043 513 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ERF2Q06551 359 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W STE6P12866 1290 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W DAL81P21657 970 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RAD16P31244 790 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W FAA2P39518 744 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YPS6P40583 537 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W DLD2P46681 530 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ADE12P80210 433 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RPM2Q02773 1202 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TDA9Q04545 1251 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YDR306CQ06640 478 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VAM6Q07468 1049 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W AKR2Q12013 749 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ADE8P04161 214 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VMA3P25515 160 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NFU1P32860 256 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SLC1P33333 303 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W ADD66P36040 267 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SDS22P36047 338 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W IES5P40060 125 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VFA1P40080 203 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YJL107CP42947 387 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NIT3P49954 291 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SUN4P53616 420 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YNL143CP53908 130 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TLG1Q03322 224 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W DDC1Q08949 612 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PRS5Q12265 496 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W HSP42Q12329 375 aa2.96□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W GAL1P04385 528 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PDC5P16467 563 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CLB1P24868 471 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W VBA3P25594 458 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CPR3P25719 182 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W CYS3P31373 394 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W STO1P34160 861 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NUP120P35729 1037 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YHI9P38765 294 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W APE4P38821 490 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SAW1P39735 261 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W BNA2P47125 453 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W RTA1P53047 317 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W NMA111P53920 997 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YPL014WQ02606 381 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PLB3Q08108 686 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SMC6Q12749 1114 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W SIN4P32259 974 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W DAL1P32375 460 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W PHA2P32452 334 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W TKL2P33315 681 aa2.95□□□□□ -1.94
SIN3YOL004W YKL075CP36083 450 aa2.95□□□□□ -1.94
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