RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	DAL3	P32459	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YBR197C	P38306	217 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ARP4	P80428	489 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SKY1	Q03656	742 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	VAC14	Q06708	880 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SWT1	Q12104	458 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	APM4	Q99186	491 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
NUP133	YKR082W	CPR2	P23285	205 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GSY1	P23337	708 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	KAP122	P32767	1081 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SLC1	P33333	303 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PMT1	P33775	817 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CTF13	P35203	478 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	BCH2	P36122	765 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YHI9	P38765	294 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PCI8	P40512	444 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MPS3	P47069	682 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RCM1	P53972	490 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CAB1	Q04430	367 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GTO3	Q04806	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YEH2	Q07950	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	NMD4	Q12129	218 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GAL7	P08431	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ADP1	P25371	1049 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ISF1	P32488	338 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	STS1	P38637	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	JJJ2	P46997	583 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ALT2	P52892	507 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ECM9	Q02202	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YML108W	Q03759	105 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GET4	Q12125	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SKM1	Q12469	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RAD61	Q99359	647 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SNT1	P25357	1226 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	COT1	P32798	439 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YME2	P32843	850 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CAF4	P36130	643 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	FES1	P38260	290 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	RTT107	P38850	1070 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	LYS9	P38999	446 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ALG5	P40350	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	XKS1	P42826	600 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PRM1	P53835	661 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CBK1	P53894	756 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	ADI1	Q03677	179 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	AIM32	Q04689	311 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PUS9	Q12069	462 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PSF3	Q12146	194 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HOS1	Q12214	470 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YER152C	P10356	443 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	APA2	P22108	325 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	SQT1	P35184	431 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HXT13	P39924	564 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HXT17	P53631	564 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GOR1	P53839	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	DIA1	P54005	336 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	HXT15	P54854	567 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	MRS2	Q01926	470 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	PDR8	Q06149	701 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	CUR1	Q06469	252 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GSH2	Q08220	491 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	GIS3	Q12418	502 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NUP133	YKR082W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms