RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	TPK2	P06245	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	KSS1	P14681	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	TEC1	P18412	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	PMA2	P19657	947 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	FAR1	P21268	830 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CCA1	P21269	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CLB3	P24870	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	TSR4	P25040	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CSM1	P25651	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	UTR2	P32623	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	OCT1	P35999	772 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ARN1	P38731	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	FET4	P40988	552 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MSS2	P40990	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MAF1	P41910	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ELP2	P42935	788 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	IRC5	P43610	853 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YJL132W	P47014	750 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	AIF1	P52923	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	HSP31	Q04432	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	FMP42	Q04991	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	RSC2	Q06488	889 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	NRT1	Q08485	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
RPL28	YGL103W	HFI1	Q12060	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	NSL1	Q12143	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPL28	YGL103W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	TRP3	P00937	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	REP1	P03871	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GDA1	P32621	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	FRE1	P32791	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	DOM34	P33309	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YBL029W	P38201	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	BIT2	P38346	545 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PEX18	P38855	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YHR182W	P38870	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	AIM18	P38884	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CYC2	P38909	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SEO1	P39709	593 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ECM10	P39987	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	VAB2	P40003	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	AVT6	P40074	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YRB2	P40517	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PFD1	P46988	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YJL055W	P47044	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RMR1	P53060	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	MON1	P53129	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	BUD32	P53323	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YNL033W	P53964	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YNL019C	P53975	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SED5	Q01590	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RCF1	Q03713	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	PLP1	Q04004	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GPI17	Q04080	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GLO2	Q05584	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CRN1	Q06440	651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YEH2	Q07950	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	ESA1	Q08649	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	VPS54	Q12071	889 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	GLC3	P32775	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL28	YGL103W	IXR1	P33417	597 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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