RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	NYV1	Q12255	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	URA3	P03962	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	MRP7	P12687	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	COS12	P53053	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	VPS64	Q03944	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	PMD1	P32634	1753 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	SWI1	P09547	1314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	RAD24	P32641	659 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	PXL1	P36166	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	FTH1	P38310	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	LAS21	P40367	830 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	CFD1	P40558	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	NIT2	P47016	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	YGL082W	P53155	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	CSI1	Q04368	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	TRE2	Q08693	809 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	MGM1	P32266	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	NUP133	P36161	1157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	CIR1	P42940	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	YJR008W	P47085	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	YNL058C	P53947	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	YML053C	Q04978	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	AMD2	P22580	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	SWC3	P31376	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	IDS2	P46958	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	SLD3	P53135	668 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	HOL1	P53389	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	PLM2	Q04383	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	PLC1	P32383	869 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	STL1	P39932	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	YNR071C	P53757	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	CTI6	Q08923	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX1	YBR228W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SCO2	P38072	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YIR016W	P40572	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	CIN1	P40987	1014 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	FCP1	Q03254	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	HKR1	P41809	1802 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	UBP12	P39538	1254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YEN1	P40028	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	GSM1	P42950	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SNA4	Q07549	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SLX1	YBR228W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	KAR1	P11927	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	MAD2	P40958	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	NUP53	Q03790	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	PEX15	Q08215	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	PFA4	Q12006	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	LCB4	Q12246	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	MAK32	P23060	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	EMP65	P40085	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	DIN7	Q12086	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	GAL4	P04386	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	RGT1	P32862	1170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	ATO2	P32907	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	GCS1	P35197	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	MDV1	P47025	714 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	CRF1	Q04930	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	SAC3	P46674	1301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	CTT1	P06115	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLX1	YBR228W	PFF1	P38244	976 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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