RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YJL070C	P40361	888 aa		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YGL081W	P53156	320 aa		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	PEX15	Q08215	383 aa		3.65	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	COX1	P00401	534 aa		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YML002W	P0CF17	737 aa		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YNL034W	P53963	612 aa		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	VPS64	Q03944	604 aa		3.64	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	HES1	P35843	434 aa		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	IML2	P47031	731 aa		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	SHE10	P53075	577 aa		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	AIM6	Q07716	390 aa		3.63	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	CBP1	P07252	654 aa		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	PMS1	P14242	873 aa		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	RAD24	P32641	659 aa		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	MRPL4	P36517	319 aa		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	CRD1	Q07560	283 aa		3.62	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	TAF5	P38129	798 aa		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	ATG27	P46989	271 aa		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	UBX6	P47049	396 aa		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YNL181W	P53878	407 aa		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	TRE2	Q08693	809 aa		3.61	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	GPA1	P08539	472 aa		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	TGL1	P34163	548 aa		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YLF2	P38746	405 aa		3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	LEU5	P38702	357 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YDR109C	Q04585	715 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	TLG2	Q08144	397 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	SLX4	Q12098	748 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.59	□□□□□ -1.83
VAR1	Q0140	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	PHO3	P24031	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	MGR1	P25573	417 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YGR079W	P53249	370 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	AAD4	Q07747	329 aa		3.58	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	BAR1	P12630	587 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	CPR3	P25719	182 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	SMA1	Q02651	245 aa		3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	KRE9	P39005	276 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YEL068C	P39977	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	PHM8	P40025	321 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YLR455W	Q06188	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	DAP1	Q12091	152 aa		3.56	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	CYB2	P00175	591 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	ADH4	P10127	382 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	KAR1	P11927	433 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	SDS22	P36047	338 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	RIM2	P38127	377 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YBR071W	P38243	211 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YNL234W	P53857	426 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	NUR1	Q12066	484 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YLR049C	Q12110	428 aa		3.55	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	MSH1	P25846	959 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	TRS65	P32893	560 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YPK3	P38070	525 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	IMA5	P40884	581 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	MSY1	P48527	492 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	GTB1	Q04924	702 aa		3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	PDR3	P33200	976 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	RRT2	P38332	387 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	SAW1	P39735	261 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	ICL2	Q12031	575 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	BSC1	Q12140	328 aa		3.53	□□□□□ -1.84
VAR1	Q0140	YHR218W	P38899	603 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	SWD1	P39706	426 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	YJR061W	P40355	935 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	RSF1	Q05043	376 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	MCP2	Q06567	569 aa		3.52	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	ASI1	P54074	624 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	PHM6	Q05637	104 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	PPT2	Q12036	173 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	BAG7	Q12128	409 aa		3.51	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	PCT1	P13259	424 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	YIR014W	P40570	242 aa		3.5	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	STE50	P25344	346 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	URK1	P27515	501 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	BUD14	P27637	709 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	IAH1	P41734	238 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	ARP10	Q04549	284 aa		3.49	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	CBS2	P14905	389 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	AVT5	P38176	459 aa		3.48	□□□□□ -1.85
VAR1	Q0140	UBP12	P39538	1254 aa		3.48	□□□□□ -1.85

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