RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	IRF6	O14896	467 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	GJA5	P36382	358 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	IQCA1	Q86XH1	822 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	CEP95	Q96GE4	821 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	TRIM75P	A6NK02	468 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	SPP2	Q13103	211 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	NEK1	Q96PY6	1258 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		29.21	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		29.2	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		29.2	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
TMEM259-208	ENST00000592052	CXCL11	O14625	94 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	NMT2	O60551	498 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	ATP2B2	Q01814	1243 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	NYAP2	Q9P242	653 aa		29.2	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	TTLL1	O95922	423 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	GTF2A2	P52657	109 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	ANAPC15	P60006	121 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	NOG	Q13253	232 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	SNAPC2	Q13487	334 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	FEZ1	Q99689	392 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	SH2D4A	Q9H788	454 aa		29.19	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L10	C9JJH3	530 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	PSMA5	P28066	241 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	MCM5	P33992	734 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	ACER1	Q8TDN7	264 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	STX8	Q9UNK0	236 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	VEGFB	P49765	207 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	BACE1	P56817	501 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	MTMR2	Q13614	643 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052		A0A1W2PRG0	241 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	C19orf81	C9J6K1	198 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	CHST3	Q7LGC8	479 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	TTC14	Q96N46	770 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	TMX2	Q9Y320	296 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	CETP	P11597	493 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	NOV	P48745	357 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	USP14	P54578	494 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	DGKH	Q86XP1	1220 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	MKL1	Q969V6	931 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	TNKS	O95271	1327 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	ERICH2	A1L162	156 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	PRC1	O43663	620 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	ANTXR2	P58335	489 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		29.14	■■■□□ 2.26
TMEM259-208	ENST00000592052	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	AOC2	O75106	756 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	HMGCS2	P54868	508 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	MTA3	Q9BTC8	594 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		29.13	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	INHBE	P58166	350 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	CCL15	Q16663	113 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TMEM259-208	ENST00000592052	IL17RA	Q96F46	866 aa		29.12	■■■□□ 2.25

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