RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521993.2

ERLIN2-209, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 3

Gene ERLIN2, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP17L22	D6RA61	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP17L19	D6RCP7	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP17L20	D6RJB6	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	CNGA1	P29973	690 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	PPP4C	P60510	307 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP17L24	Q0WX57	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	PI16	Q6UXB8	463 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	SRGAP3	O43295	1099 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	IGSF3	O75054	1194 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	GDF11	O95390	407 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	HLA-DOA	P06340	250 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	HOXC6	P09630	235 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	PTPRE	P23469	700 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	RTP1	P59025	263 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	SHH	Q15465	462 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	WDR78	Q5VTH9	848 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	C12orf42	Q96LP6	360 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	DNAJC18	Q9H819	358 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	GNAI3	P08754	354 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	USP14	P54578	494 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	MTX1	Q13505	466 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	PALD1	Q9ULE6	856 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	FLT1	P17948	1338 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	KBTBD13	C9JR72	458 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	CNMD	O75829	334 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	CYP2C19	P33261	490 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	MCAM	P43121	646 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	LBX2	Q6XYB7	198 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	MEIS3	Q99687	375 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	FEZ1	Q99689	392 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	STRN	O43815	780 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	GH2	P01242	217 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	FOSL2	P15408	326 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	GRB14	Q14449	540 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	MYLIP	Q8WY64	445 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	BAD	Q92934	168 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	TTC28	Q96AY4	2481 aa		12.02	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		12.02	□□□□□ -0.48
ERLIN2-209	ENST00000521993	IGHA2	P01877	340 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	RLBP1	P12271	317 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	CYBA	P13498	195 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	DPP9	Q86TI2	863 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRPV1	Q8NER1	839 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	BTBD7	Q9P203	1132 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	SEPT4	O43236	478 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	VCAM1	P19320	739 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNX17	Q15036	470 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	TRIM60	Q495X7	471 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	CERS3	Q8IU89	383 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	CABP5	Q9NP86	173 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	SNRK	Q9NRH2	765 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	HMMR	O75330	724 aa		12	□□□□□ -0.49
ERLIN2-209	ENST00000521993	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		12	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms