RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 HTTP42858 3142 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 ELP3Q9H9T3 547 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 UNCXA6NJT0 531 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 MYO1BO43795 1136 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 UBE4AQ14139 1066 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 SV2AQ7L0J3 742 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 OPTNQ96CV9 577 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 MRS2Q9HD23 443 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 CRKP46108 304 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC24Q50LG9 513 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 ARMC5Q96C12 935 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 ERO1AQ96HE7 468 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH1L1O75891 902 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CACNB3P54284 484 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 SP3Q02447 781 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 VGLL4Q14135 290 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 GAS6Q14393 721 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 EFCC1Q9HA90 598 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 UTYO14607 1347 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.26□□□□□ -1.09
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HOXD8-202ENST00000429017 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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HOXD8-202ENST00000429017 CCL15Q16663 113 aa8.26□□□□□ -1.09
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HOXD8-202ENST00000429017 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TNFAIP1Q13829 316 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF333Q96JL9 665 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 BRCA2P51587 3418 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CDC14CA4D256 554 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 FGFR2P21802 821 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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HOXD8-202ENST00000429017 CENPFP49454 3210 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF521Q96K83 1311 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 BTBD19C9JJ37 291 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 PDE8BO95263 885 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 CTGFP29279 349 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 GTF2A2P52657 109 aa8.24□□□□□ -1.09
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HOXD8-202ENST00000429017 METTL24Q5JXM2 366 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 RNF217Q8TC41 542 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MSTNO14793 375 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 TNNI2P48788 182 aa8.23□□□□□ -1.09
HOXD8-202ENST00000429017 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.23□□□□□ -1.09
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