RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIN3	YOL004W	FLR1	P38124	548 aa		3	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PAN5	P38787	379 aa		3	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	DIP5	P53388	608 aa		3	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PMT7	Q06644	662 aa		3	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YOR342C	Q12182	319 aa		3	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	STE12	P13574	688 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	MMS4	P38257	691 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YPL109C	Q02981	657 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	MLH2	Q07980	695 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RMP1	Q12530	201 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RER1	P25560	188 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	MKS1	P34072	584 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	CCT6	P39079	546 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	MNT3	P40549	630 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YGR053C	P53234	283 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YVC1	Q12324	675 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ZIP2	P53061	704 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	VPS30	Q02948	557 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	MDM30	Q05930	598 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YEH1	Q07804	573 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PSK2	Q08217	1101 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	STF1	P01098	86 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	UBP11	P36026	717 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	NMD5	P46970	1048 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ORC4	P54791	529 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ECM7	Q06200	448 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	BSC6	Q08280	497 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RDS1	P25611	832 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	DBF4	P32325	704 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ANP1	P32629	500 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SLA2	P33338	968 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	GIP2	P40036	548 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RAD26	P40352	1085 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ABM1	P47146	123 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	MUP1	P50276	574 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ARK1	P53974	638 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	IVY1	Q04934	453 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YDL057W	Q07379	328 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RSC6	P25632	483 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YKL107W	P34251	309 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	MRX3	P38172	270 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	UBP13	P38187	747 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	NDE1	P40215	560 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YGL242C	P53066	181 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	BTN2	P53286	410 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PRM6	Q04705	352 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	GNT1	Q12096	491 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	NDT80	P38830	627 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SAE2	P46946	345 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	TAD1	P53065	400 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YIP4	P53093	235 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	INN1	P53901	409 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	GTR1	Q00582	310 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	VPS60	Q03390	229 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	BLS1	Q06071	122 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	NTA1	P40354	457 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YJR120W	P47157	116 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	FMS1	P50264	508 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ENA1	P13587	1091 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	HOP1	P20050	605 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SFC1	P33303	322 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	CAJ1	P39101	391 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	YJR054W	P47114	497 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	SLD3	P53135	668 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ENA2	Q01896	1091 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	HRT3	Q12347	344 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	ENA5	Q12691	1091 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	CCW14	O13547	238 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SIN3	YOL004W	FLP1	P03870	423 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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