RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 GREM2Q9H772 168 aa20.92■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.92■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.92■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC151A5D8V7 595 aa20.91■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGA6P23229 1130 aa20.91■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 BRD3Q15059 726 aa20.91■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.91■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.91■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 ATRNO75882 1429 aa20.91■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 POSTNQ15063 836 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 C8orf37Q96NL8 207 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 DESI2Q9BSY9 194 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNQ2O43526 872 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE6AP16499 860 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 LMAN1P49257 510 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.9■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE3CQ15386 1083 aa20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.89■□□□□ 0.94
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF18P17022 549 aa20.89■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PHKA1P46020 1223 aa20.89■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP10Q86W26 655 aa20.89■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.89■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 AIDAQ96BJ3 306 aa20.89■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.89■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MYO1CO00159 1063 aa20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE4CQ08493 712 aa20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MED15Q96RN5 788 aa20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP1P03956 469 aa20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1AP38606 617 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP4BP1P59074 171 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 BARGINQ6ZT62 677 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 IQUBQ8NA54 791 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ITPK1Q13572 414 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MTF1Q14872 753 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 NGLY1Q96IV0 654 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.87■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM66O15016 1216 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPREP23469 700 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTN2P35609 894 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 LIFRP42702 1097 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 NR5A1Q13285 461 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 USP49Q70CQ1 688 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 STK36Q9NRP7 1315 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP2B1P20020 1258 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SIK1P57059 783 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MORC3Q14149 939 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 RAI14Q9P0K7 980 aa20.86■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC175P0C221 793 aa20.85■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNAR1P17181 557 aa20.85■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.85■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MLKLQ8NB16 471 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms