RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 SHMT1P34896 483 aa21.54■■□□□ 1.04
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SBDSP1-202ENST00000423945 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.54■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.54■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 EFCC1Q9HA90 598 aa21.54■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.54■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.54■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.54■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.54■■□□□ 1.04
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SBDSP1-202ENST00000423945 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.53■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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SBDSP1-202ENST00000423945 SMIM22K7EJ46 135 aa21.52■■□□□ 1.04
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SBDSP1-202ENST00000423945 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.52■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 GCC1Q96CN9 775 aa21.52■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.52■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 GINM1Q9NU53 330 aa21.52■■□□□ 1.04
SBDSP1-202ENST00000423945 GH2P01242 217 aa21.51■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 OSBP2Q969R2 916 aa21.51■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 MYH8P13535 1937 aa21.51■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 GUCY1A2P33402 732 aa21.5■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.5■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.49■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.49■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.49■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 ERC2O15083 957 aa21.48■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 APPBP2Q92624 585 aa21.48■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 TRIM47Q96LD4 638 aa21.48■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 STAP2Q9UGK3 403 aa21.48■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.48■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L10C9JJH3 530 aa21.47■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.47■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 C12orf60Q5U649 245 aa21.47■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.46■■□□□ 1.03
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SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L21D6R901 530 aa21.46■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 PSMC4P43686 418 aa21.46■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 KIF22Q14807 665 aa21.46■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 CTR9Q6PD62 1173 aa21.46■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.46■■□□□ 1.03
SBDSP1-202ENST00000423945 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 C19orf81C9J6K1 198 aa21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 PDE1AP54750 535 aa21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ACER1Q8TDN7 264 aa21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 OSBPP22059 807 aa21.44■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 SEPT2Q15019 361 aa21.44■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.44■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ARMC5Q96C12 935 aa21.44■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 LNPKQ9C0E8 428 aa21.44■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 PNMA3Q9UL41 463 aa21.44■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.43■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 C12orf42Q96LP6 360 aa21.43■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.43■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 SWAP70Q9UH65 585 aa21.43■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 AKR1B1P15121 316 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 CDK8P49336 464 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.42■■□□□ 1.02
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