RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 MOB2Q70IA6 237 aa34.95■■■■□ 3.18
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF112Q9UJU3 913 aa34.95■■■■□ 3.18
ECHS1-201ENST00000368547 ATAD5Q96QE3 1844 aa34.94■■■■□ 3.18
ECHS1-201ENST00000368547 OTOFQ9HC10 1997 aa34.94■■■■□ 3.18
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ECHS1-201ENST00000368547 IL17RAQ96F46 866 aa34.94■■■■□ 3.18
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ECHS1-201ENST00000368547 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
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ECHS1-201ENST00000368547 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.181e-7■■■□□ 16.3
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ECHS1-201ENST00000368547 ZSWIM5Q9P217 1185 aa34.89■■■■□ 3.18
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ECHS1-201ENST00000368547 TM6SF1Q9BZW5 370 aa34.84■■■■□ 3.17
ECHS1-201ENST00000368547 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
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ECHS1-201ENST00000368547 ASNSP08243 561 aa34.84■■■■□ 3.17
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ECHS1-201ENST00000368547 GUCY1A2P33402 732 aa34.83■■■■□ 3.17
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ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
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ECHS1-201ENST00000368547 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
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ECHS1-201ENST00000368547 PRC1O43663 620 aa34.81■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC10AQ8IUN9 316 aa34.81■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa34.8■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 RUFY3Q7L099 469 aa34.8■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 CEP95Q96GE4 821 aa34.8■■■■□ 3.16
ECHS1-201ENST00000368547 TCEANC2Q96MN5 208 aa34.8■■■■□ 3.16
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