RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 BICD2Q8TD16 824 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 FBXO41Q8TF61 875 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 WASF1Q92558 559 aa20.77■□□□□ 0.92
ACTB-201ENST00000331789 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.77■□□□□ 0.92
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ACTB-201ENST00000331789 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.77■□□□□ 0.92
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ACTB-201ENST00000331789 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.73■□□□□ 0.91
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ACTB-201ENST00000331789 TSPY8P0CW00 308 aa20.71■□□□□ 0.91
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ACTB-201ENST00000331789 NT5C2P49902 561 aa20.7■□□□□ 0.9
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ACTB-201ENST00000331789 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K11Q16584 847 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 AOC3Q16853 763 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-201ENST00000331789 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.68■□□□□ 0.9
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