RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CDC9	P04819	755 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ARG81	P05085	880 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ARG3	P05150	338 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GCR1	P07261	785 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YEL043W	P32618	956 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DOM34	P33309	386 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DID4	P36108	232 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ALG3	P38179	458 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	APD1	P38281	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	POP7	P38291	140 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MNL1	P38888	796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PIK1	P39104	1066 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YJR061W	P40355	935 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YIL089W	P40500	205 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YIL077C	P40508	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	IAH1	P41734	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SNZ3	P43545	298 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SGF73	P53165	657 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SNZ2	P53824	298 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MRPL22	P53881	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SSL2	Q00578	843 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SMA1	Q02651	245 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MUK1	Q02866	612 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	EEB1	Q02891	456 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ECM18	Q04623	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SPC2	Q04969	178 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	BCP1	Q06338	283 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GUD1	Q07729	489 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	HOS1	Q12214	470 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RTN2	Q12443	393 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RAD18	P10862	487 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YPK2	P18961	677 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PHO91	P27514	894 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MSP1	P28737	362 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SRP101	P32916	621 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	NUP133	P36161	1157 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	CKB2	P38930	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YDR089W	P38966	869 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	NPR2	P39923	615 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	YTA12	P40341	825 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MND2	P40577	368 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GTS1	P40956	396 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	LYS14	P40971	790 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SNX4	P47057	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TEP1	P53916	434 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	ESBP6	P53918	673 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	SPO19	Q03029	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	UFO1	Q04511	668 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	PDR8	Q06149	701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	HER1	Q12276	1246 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	GIS3	Q12418	502 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YPT53	YNL093W	TPK1	P06244	397 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	NUC1	P08466	329 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	UNG1	P12887	359 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SEC63	P14906	663 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SFL1	P20134	766 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RAD53	P22216	821 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	MRPL8	P22353	238 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	OCA4	P25366	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	SGF29	P25554	259 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	EMC1	P25574	760 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	RDS1	P25611	832 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ADK2	P26364	225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YPT53	YNL093W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms