RNA–Protein interactions for RNA: YMR274C

RCE1, Transcript of Type II CAAX prenyl protease, yeast

Gene RCE1, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCE1	YMR274C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	YIR016W	P40572	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	MDV1	P47025	714 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	PLM2	Q04383	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
RCE1	YMR274C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	VPS8	P39702	1274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	NIT2	P47016	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	AAT1	Q01802	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	ATX2	Q12067	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	LCB4	Q12246	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	GAL4	P04386	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	LNP1	P38878	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	MAD2	P40958	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	MAF1	P41910	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	IDS2	P46958	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	SLD3	P53135	668 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	BOP3	P53958	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	YML053C	Q04978	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	DIN7	Q12086	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	SCO2	P38072	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	STL1	P39932	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	RAD26	P40352	1085 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	YNR071C	P53757	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	RAD34	Q06665	692 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	YAT2	P40017	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	GSM1	P42950	618 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	HOL1	P53389	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	PFA4	Q12006	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RCE1	YMR274C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	UBX3	Q12229	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	ERV46	P39727	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	EMP65	P40085	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	VTC3	Q02725	835 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	ARA2	Q04212	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	TRE2	Q08693	809 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	NDD1	Q08887	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	YCR061W	P25639	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	YAT1	P80235	687 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	VFA1	P40080	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	RRI1	Q12468	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	YCR043C	P25361	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	YIL152W	P40455	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	ORC5	P50874	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	CRF1	Q04930	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	PEX15	Q08215	383 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	DSE3	Q08729	430 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RCE1	YMR274C	CTT1	P06115	562 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	CNA1	P23287	553 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	UBP12	P39538	1254 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YJL107C	P42947	387 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YPT11	P48559	417 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	TRI1	Q05024	226 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YBR071W	P38243	211 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
RCE1	YMR274C	ACS1	Q01574	713 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	TRS31	Q03337	283 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	GSH1	P32477	678 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YNL144C	P53907	740 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	PSF3	Q12146	194 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	KAR1	P11927	433 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	PTC6	P25646	442 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	ARN1	P38731	627 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YEN1	P40028	759 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	POL31	P46957	487 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	YGL081W	P53156	320 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	GRS2	Q06817	618 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	NRT1	Q08485	598 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RCE1	YMR274C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69

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