RNA–Protein interactions for RNA: YMR018W

YMR018W, Transcript of Putative protein of unknown function with similarity to human PEX5Rp, yeast

Gene YMR018W, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR018W	YMR018W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.59	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	VPS15	P22219	1454 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SRD1	P09007	221 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RAD18	P10862	487 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	TUP1	P16649	713 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	PET123	P17558	318 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RPC34	P32910	317 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	PXA2	P34230	853 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SET3	P36124	751 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RXT2	P38255	430 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	HSL7	P38274	827 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YBR242W	P38331	238 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	NUP60	P39705	539 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YEL020C	P39994	560 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RSM25	P40496	264 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	GCD10	P41814	478 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	BNA2	P47125	453 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SGM1	P47166	707 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	NUP84	P52891	726 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SHE10	P53075	577 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	DIP5	P53388	608 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	GYL1	Q04322	720 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SWA2	Q06677	668 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	OPY2	Q06810	360 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	DNF2	Q12675	1612 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SIR3	P06701	978 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	HOM3	P10869	527 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	OCA4	P25366	362 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ITR1	P30605	584 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	HOG1	P32485	435 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ANP1	P32629	500 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YKL063C	P35725	167 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	MIA40	P36046	403 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ECM4	P36156	370 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	IFA38	P38286	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	UBS1	P38290	277 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	FMO1	P38866	432 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	CAJ1	P39101	391 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	FMP10	P40098	244 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ESL1	P40456	1118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	STB1	P42845	420 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SSN8	P47821	323 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RNH70	P53331	553 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	HST1	P53685	503 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YPR089W	O13585	888 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ITR2	P30606	609 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YEL043W	P32618	956 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	PTR2	P32901	601 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	TFC4	P33339	1025 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RSM22	P36056	628 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	MIC60	P36112	540 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	HEL1	P36113	551 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	GLG1	P36143	616 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	PEX18	P38855	283 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
YMR018W	YMR018W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
YMR018W	YMR018W	RTT105	P40063	208 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ARG2	P40360	574 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	MNT3	P40549	630 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	POL31	P46957	487 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SRB7	P47822	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	CTR1	P49573	406 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YGL082W	P53155	381 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YGR266W	P53326	701 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	IPI3	P53877	555 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YNL144C	P53907	740 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	ADA2	Q02336	434 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	RAD33	Q04231	177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YMR018W	Q04364	514 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	YLH47	Q06493	454 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	SYO1	Q07395	620 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	MLH2	Q07980	695 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YMR018W	YMR018W	NTG2	Q08214	380 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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