RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
CLF1	YLR117C	HER1	Q12276	1246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MAM3	Q12296	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ATP6	P00854	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SIR3	P06701	978 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SPO16	P17122	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	VPS33	P20795	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GPI10	P30777	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TFC1	P32367	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SET3	P36124	751 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MMS21	P38632	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MEF2	P39677	819 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DSE1	P40077	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	UBP7	P40453	1071 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PRK1	P40494	810 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YIL077C	P40508	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NAS6	P50086	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MRPL50	P53724	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DID2	P69771	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SDH1	Q00711	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GIS4	Q04233	774 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ARV1	Q06541	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MCH5	Q08777	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RTR2	Q12378	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GTT2	Q12390	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ATG31	Q12421	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ERG12	P07277	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RAD14	P28519	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RTG1	P32607	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CPR5	P35176	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TGL4	P36165	910 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YBR285W	P38354	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MSS4	P38994	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	VHR2	P40041	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	HXT10	P43581	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SAS4	Q04003	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ASA1	Q06822	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NTG2	Q08214	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MED2	Q12124	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	HEM15	P16622	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CBF1	P17106	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ATP12	P22135	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	KRE2	P27809	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	IRE1	P32361	1115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	AFR1	P33304	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YBP1	P38315	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YHR219W	P38900	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PSF2	P40359	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YJL049W	P47048	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YJR008W	P47085	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YJR098C	P47139	656 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ATG34	Q12292	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YLR462W	O13556	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RAP1	P11938	827 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PMS1	P14242	873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CKA2	P19454	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PMA2	P19657	947 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	VPS34	P22543	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PTP2	P29461	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YHL049C	P38722	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CLF1	YLR117C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YEL075C	P39972	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YER189W	P40104	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MSS2	P40990	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YFL064C	P43540	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DAK2	P43550	591 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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