RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	SLA2	P33338	968 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	VBA5	P36172	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RDH54	P38086	958 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	APN2	P38207	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	GIP1	P38229	639 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YBR259W	P38338	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	GEM1	P39722	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CHS6	P40955	746 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	IAH1	P41734	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ERR3	P42222	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	LAM5	P43560	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SUM1	P46676	1062 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	MAD3	P47074	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	AZR1	P50080	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TEL2	P53038	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YGL108C	P53139	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	HST2	P53686	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TEP1	P53916	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ASI1	P54074	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	HED1	Q03937	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RKM2	Q03942	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SND1	Q04007	877 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	APC5	Q08683	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RAD51	P25454	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YSC84	P32793	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	BEM3	P32873	1128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CYM1	P32898	989 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	BZZ1	P38822	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	AIM18	P38884	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PEA2	P40091	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	MAM33	P40513	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YJL132W	P47014	750 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ACF4	P47129	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PEX31	P53203	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YGR016W	P53209	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	COG2	P53271	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	VPS9	P54787	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PSR1	Q07800	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	THI20	Q08224	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	NRT1	Q08485	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CHS1	P08004	1131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SEC63	P14906	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YKR015C	P36111	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	PHO89	P38361	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	DSE1	P40077	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	INP2	Q03824	705 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CDC123	Q05791	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	RSC2	Q06488	889 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AAD15	Q08361	143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MCH5	Q08777	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	VPS54	Q12071	889 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	ECM29	P38737	1868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	GLN3	P18494	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	AFT1	P22149	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBX7	YBR273C	CLB3	P24870	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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