RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.62□□□□□ -0.55
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAPN2P17655 700 aa11.62□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BTDP43251 543 aa11.62□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DPF3Q92784 378 aa11.62□□□□□ -0.55
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 RARSP54136 660 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GSTO1P78417 241 aa11.61□□□□□ -0.55
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 PICALMQ13492 652 aa11.61□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MTX1Q13505 466 aa11.61□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GABRQQ9UN88 632 aa11.61□□□□□ -0.55
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FLT3LGP49771 235 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RHBDL3P58872 404 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IRF5Q13568 498 aa11.6□□□□□ -0.55
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NEUROD6Q96NK8 337 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PNMA3Q9UL41 463 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.6□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SGPL1O95470 568 aa11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLURP2P0DP57 97 aa11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPATA5Q8NB90 893 aa11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.59□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.59□□□□□ -0.55
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 GNAI2P04899 355 aa11.58□□□□□ -0.56
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.58□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF384Q8TF68 577 aa11.58□□□□□ -0.56
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CEP290O15078 2479 aa11.57□□□□□ -0.56
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM196BA6NMK8 535 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BAG3O95817 575 aa11.55□□□□□ -0.56
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLCG2P16885 1265 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MCAMP43121 646 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HMGCS2P54868 508 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DEFB118Q96PH6 123 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.55□□□□□ -0.56
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FOCADQ5VW36 1801 aa11.54□□□□□ -0.56
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