RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CS-214ENST00000548849 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.947e-8■■■□□ 15.6
CS-214ENST00000548849 IRF5Q13568 498 aa20.95■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 GNAI2P04899 355 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 TEX11Q8IYF3 940 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 DEFB118Q96PH6 123 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 CAP2P40123 477 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 MCAMP43121 646 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 HMGCS2P54868 508 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 TNNQ9UQP3 1299 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 USP17L5A8MUK1 530 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 TRIM27P14373 513 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 CAPN2P17655 700 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 SNRKQ9NRH2 765 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
CS-214ENST00000548849 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 EVI5O60447 810 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 BCAR3O75815 825 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 BAG3O95817 575 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 SZT2Q5T011 3432 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
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CS-214ENST00000548849 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 PRO3102Q9H379 93 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 CCER2I3L3R5 266 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 HMGCRP04035 888 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 PLCG2P16885 1265 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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CS-214ENST00000548849 TNNI3KQ59H18 835 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 WDR18Q9BV38 432 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 GJD2Q9UKL4 321 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.85■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 ASNSP08243 561 aa20.84■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 BACE1P56817 501 aa20.84■□□□□ 0.93
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CS-214ENST00000548849 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.84■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.84■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
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CS-214ENST00000548849 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 TRIM32Q13049 653 aa20.83■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.83■□□□□ 0.93
CS-214ENST00000548849 FLT1P17948 1338 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 GDF11O95390 407 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 CYP2B6P20813 491 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 JAG1P78504 1218 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 POLA2Q14181 598 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 STAP2Q9UGK3 403 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-214ENST00000548849 PALD1Q9ULE6 856 aa20.82■□□□□ 0.92
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