RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	RASA3	Q14644	834 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C1W4	665 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF5L	O75529	589 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAP23	O00161	211 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF22	Q14807	665 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL15	Q16663	113 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN18	Q99952	460 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PLIN1	O60240	522 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GCKR	Q14397	625 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	QPCT	Q16769	361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CSF1R	P07333	972 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1R1	P14778	569 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TNNI2	P48788	182 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2A2	P52657	109 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YGN5	161 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPD8	Q6UX82	237 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	G2E3	Q7L622	706 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	AOX1	Q06278	1338 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FLII	Q13045	1269 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	VGLL4	Q14135	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	DPF3	Q92784	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	HTT	P42858	3142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CAP1	Q01518	475 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MYH3	P11055	1940 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CETP	P11597	493 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP7	P55210	303 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SKAP2-209	ENST00000497511	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GFRA3	O60609	400 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM32	Q13049	653 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TSC1	Q92574	1164 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPF	P49454	3210 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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